高远研究员于2016年在中国科学院大学获得遗传学博士学位,之后在美国宾夕法尼亚大学和费城儿童医院进行博士后研究,2021年加入中国科学院北京基因组研究所任研究员、博士生导师,近年来以通讯或
第一
作者在
Nature Methods
、
Science Advances
、
Trends in Genetics
、
Nature Communications
、
Advanced Science
、
Genome Biology
及
Briefings in Bioinformatics
等国际著名期刊上发表多篇论文。
课题组聚焦生物信息学算法开发及数据资源整合,并通过挖掘组学数据探究生命与健康前沿问题,研究方向主要包括:1.疾病及营养相关的功能微生物组学研究;2.人体及模式动物的空间组学研究;3.长读段高通量测序组学数据整合、分析及相关算法开发。其他详情请浏览
实验室主页
。
1.
Zhou Z
†
, Zhang J
†
,
Zheng X
, Pan Z, Zhao F*,
Gao Y*
. CIRI-deep enables single-cell and spatial transcriptomic analysis of circular RNAs with deep learning [J].
Advanced Science
, 2024, DOI: 10.1002/advs.202308115.
2.
Gao Y
, Li H*. Quantifying and comparing bacterial growth dynamics in multiple metagenomic samples [J].
Nature Methods,
2018, 15(12): 1041.
3.
Gao Y
†
*, Wang F
†
, Wang R
†
, Kutschera E, Xu Y, Xie S, Wang Y, Kadash-Edmondson K, Lin L, Xing Y*. ESPRESSO: Robust discovery and quantification of transcript isoforms from error-prone long-read RNA-seq data [J].
Science Advances
,
2023, 9(3), eabq5072.
4.
Gao Y
†
, Wang J
†
, Zhao F*. CIRI: an efficient and unbiased algorithm for
de novo
circular RNA identification [J].
Genome Biology
, 2015, 16(1): 4.
5.
Gao Y
†
, Wang J
†
, Zheng Y
†
, Zhang J, Chen S & Zhao F*. Comprehensive identification of internal structure and alternative splicing events in circular RNAs [J].
Nature Communications
, 2016, DOI: 10.1038/ncomms12060.
6.
Gao Y
, Zhao F*. Computational strategies for exploring circular RNAs [J].
Trends in Genetics
,
2018, 34(5): 389-400.
7.
Gao Y
, Zhang J, Zhao F*. Circular RNA identification based on multiple seed matching [J].
Briefings in Bioinformatics
, 2018, 19(5): 803-810.
8.
Wang J
†
,
Gao Y
†
, Zhao F*. Phage–bacteria interaction network in human oral microbiome [J].
Environmental Microbiology
, 2016, 7(18): 2143-2158.
9.
Xin R
†
, Gao Y
†
,
Gao Y
, Wang R, Kadash-Edmondson K & Xing Y*. isoCirc catalogs full-length circular RNA isoforms in human transcriptomes[J].
Nature Communications
, 2021, 12(1): 1-11.
10.
Tanes C
†
, Bittinger K
†
,
Gao Y
, Friedman S E, Nessel L, RoyPaladhi U, Chau L, Panfen E, Fischbach M A, Braun J, Xavier R J, Clish C B, Li H, Bushman F D, Lewis J D* & Wu G D*. Role of dietary fiber in the recovery of the human gut microbiome and its metabolome[J].
Cell Host & Microbe
, 2021, 29(3): 394-407. e5.
1.年龄不超过35周岁;近3年内获得或即将获得生物、数学/统计或计算机相关专业博士学位(申请助理工程师需计算机或数学/统计相关专业硕士学位)。
2.计算领域申请者要求具有基因组学数据分析经验,且熟悉linux开发环境并熟练掌握至少一门编程语言(python/java/c++/perl等)及R绘图,具备生物信息学算法开发经验者优先;实验领域申请者要求熟练掌握分子生物学实验技能,具备高通量测序建库经验或实验室管理经验者优先。
3.诚实稳重、责任心强,具有较好的组织、沟通和协调能力,富有团队合作精神,对科研工作充满热情。
4.以第一作者在国际期刊发表过论文,具备良好的专业英文读写能力,能独立开展科研工作。
5.申请助理研究员的,根据中科院规定需具有至少一个聘期的博士后研究经历。
根据申请者研究背景,提供具有竞争力的薪酬待遇:
1.特别研究助理(博士后)年薪25-35万(入选中科院特别资助项目的可获最高年薪40万);
2.助理研究员/工程师 25-30万,助理工程师16-25万。
助理研究员及工程师为中级职称事业编制人员,助理工程师为初级职称事业编制人员,享受中科院正式员工福利
(例如,根据人事政策应届生一般可获得
北京户口
),表现优秀者可获得推荐晋升高级职称或申请人才项目;
特别研究助理(博士后)
表现优秀者,聘期结束后可获得推荐
留所长聘、出国深造
及其他后续支持。