每日文摘 | 2022年08月17日
VDJdb in the pandemic era: a compendium of T cell receptors specific for SARS-CoV-2 | Nature Methods
在这里，研究人员报告了 VDJdb 数据库 ( https:// vdjdb.cdr3.net ) 2019 年至 2022 年间的更新，包括了 COVID-19 的病原体 SARS-CoV-2。
iPiDA-LTR: Identifying piwi-interacting RNA-disease associations based on Learning to Rank | PLOS Computational Biology
Piwi-interacting RNAs (piRNAs) 被认为是疾病诊断和治疗的药物靶点和生物标志物。在这项研究中，提出了 iPiDA-LTR 预测器来识别 piRNA 与基于学习排序的疾病之间的关联。 iPiDA-LTR 预测器不仅可以识别已知 piRNA 与疾病之间缺失的关联，还可以检测与新检测到的 piRNA 相关的疾病。
Quantifying the phenotypic information in mRNA abundance | Molecular Systems Biology
量化 mRNA 丰度和下游细胞表型之间的依赖性是生物学中一个基本的开放性问题。使用信息论方法，研究人员分析了 Ca2+ 信号网络中 83 个基因表达的多模态数据以及同一细胞中的动态 Ca2+ 反应。他们发现这 83 个基因的总体表达水平解释了大约 60% 的 Ca2+ 信号熵。
