美国政府利用卫星监听和定位系统直监视着著名的毒枭毒药，在确定他的交易位置后，将任务交给了缉毒局在哥伦比亚的卧底墨菲。墨菲在哥伦比亚的行动受限，于是打电话报警，将信息透露给自己的搭档搜捕队的潘那。 潘那组织人手突袭了毒药的交易现场，一时间也是血流成河。早在1973年的智利，军方抓捕并处决了三百多名的毒贩，代号蟑螂的毒贩死里逃生，摇身一变成了最大的毒贩。而走私商人埃斯科瓦尔收买了全国大部分的警力，让自己的走私生意开展的顺风顺水，就算偶尔有不愿意配合的警察，埃斯科瓦尔也能和颜悦色的威逼利诱从而使大家顺从他。蟑螂找上了埃斯科瓦尔，想让他帮助销售自己生产的可卡因，埃斯科瓦尔对此很感兴趣，两人一拍即合。蟑螂带着埃斯科瓦尔去自己秘鲁的生产基地参观，而此时蟑螂的制毒基地还是个小小的作坊。埃斯科卡尔利用自己的关系，用汽车将毒品运送出去，仅仅这一趟他就轻轻松松的赚取了五十多万美金的利润。这样，蟑螂和埃斯科卡尔的联系更加的紧密起来。那时的墨菲还在迈阿密执行任务，他因为同事的恶作剧认识自己的妻子，从此陷入情网。回到麦德林后，埃斯科瓦尔建立了自己的实验室，由蟑螂负责制毒，自己和古斯塔沃负责销售出去。古斯塔沃找到了一个叫狮子的人，将毒品带到迈阿密，卖给那里的权贵们。很快埃斯科卡尔富得流油，可卡因源源不断的从秘鲁运到麦德林，单凭狮子一个人已经很难讲他们全部都运送出去。于是狮子收买利用航空公司的飞行员、孕妇、年轻的女孩子将毒品运送出去，再后来埃斯科卡尔在短短的几个月时间内建立了第一条哥伦毕业到美国的毒品运输航线。最后，埃斯科瓦尔关掉了麦德林的实验室，将制毒的作坊搬进了哥伦比亚郁郁葱葱的大森林里，在树林的掩饰之下加大了生产力度。制毒贩毒给埃斯科瓦尔带来了源源不断的财富，增加了蟑螂的不安和不满，也吸引了埃斯科瓦尔商场上的朋友，很快一张巨大的贩毒网络形成了。而墨菲也从追着吸毒的嬉皮士变成了开枪打死贩毒着的缉毒警察。回去之后，墨菲对于自己打死未成年的贩毒者耿耿于怀，但是妻子却说那人本就该死。追问之下，墨菲才知道妻子的医院送来了一个因毒品破碎而惨死的女孩子，尽管妻子尽了全力但还是不能挽救她的生命。埃斯科瓦尔的一批货被早就已经买通的警察合埃拉截住，埃斯科瓦尔一气之下冲到了警局和合埃拉谈判。埃斯科瓦尔被作为嫌疑犯拍下了照片，两人重新订立了协议，合埃拉也将蟑螂供了了出来。原来蟑螂不满埃斯科瓦尔赚的盘满钵满而自己只能窝在从林中，于是私下偷了可卡因，雇了一个哥伦比亚管道公司的人贩卖。不幸的是，管道公司的贩毒车辆载着1200斤毒品被墨菲和同事截获，同事在打斗中不幸身亡，而墨菲成为了英雄。埃斯科瓦尔带人灭了蟑螂的人员，杀死了一千多警察，而这些都是墨菲后来才知道的。古斯塔沃将毒药被被缉毒局的人枪杀的消息告诉了埃斯科瓦尔，问他是否要悬赏捉拿杀害毒药的人，埃斯科瓦尔沉默不语。

墨菲和夫人康妮乘坐飞机到哥伦比亚，从飞机上看下去，哥伦比亚就是一个纯净的森林公园，壮观而美丽。殊不知，在层层叠翠的掩盖之下，罪恶不断的滋生蔓延，可卡因不断的被制造出来，流向世界的其他地方，为毒枭们带来源源不断的美金。雷德专门买下了一座小岛，作为毒品和金钱的流转地，很快小岛就成了毒枭们享乐的乐园。随着毒品越来越泛滥，毒枭们面临着如何将大量的现金转换成合法收入的问题。埃斯科瓦尔开了一家出租车公司进行洗钱，无法洗白的现金被成捆的藏在了各种地方。甚至埃斯科瓦尔开始做起了慈善，将大量的现金直接分发给穷人，一时之间在麦德林穷人中间的呼声极高，埃斯科瓦尔甚至放出了要当总统的豪言。毒枭们的巨额财富引起了当地的共产主义组织M-19的注意，他们决定绑架奥乔亚兄弟的妹妹玛尔塔，以此来谋取大量的赎金。那一天是狮子完成了自己往返美国的第一百趟行程，也是墨菲夫妇到哥伦比亚的第一天。墨菲夫妇一到哥伦比亚就在机场以携带宠物猫的文件不充分被请到了办公室了。但墨菲万万没有想到的是，自己在刚刚踏上哥伦比亚的土地上时就已经被毒枭盯上，而自己连个毒枭的影子都还没有见着。墨菲在哥伦比亚的搭档潘那擅长从那些被毒枭睡过的妓女们身上获得情报。潘那在妓女中发展了一个叫海伦娜的线人，海伦娜迫切的希望潘那能为她提供去美国的签证。两人在一番云雨后，海伦娜告诉潘那自己和其他的女孩即将出发去麦德林。潘那带着墨菲认识了大使馆的人，有带着墨菲找到大使，要求得到麦德林的情报，说毒枭们齐聚麦德林肯定会有大动作。在得到大使的同意之后，潘那带着墨菲来到麦德林和卡里略上校会和，一同到酒店拍摄下毒枭们的照片以增强印象。果不其然，埃斯科瓦尔利用这次玛尔塔被绑架的契机将所有的毒枭聚在一起，宣布成立绑架者终结联盟，宣布自己是组织的老大，负责组织的日常运转，条件就是保证毒枭们不受M-19的困扰。会后，毒枭们寻欢作乐。海伦娜主动勾引了嘎查，状似无意的问起了今天在会上的内容，引起了本性多疑的嘎查的注意。海伦娜被嘎查丢给了下面的小毒枭，可怜的海伦娜遭到了惨无人道的轮奸。潘那迟迟等不到海伦娜的出现，和卡里略上校带人将奄奄一息的海伦娜救了出来。墨菲对于潘那留下他独自行动表示强烈的不满，潘那希望他能明白自己坚持的真正含义是什么。埃斯科瓦尔对M-19的组织进行了大屠杀，M-19迫于压力只好放了玛尔塔。埃斯科瓦尔将M-19被杀人员的照片寄给报社，M-19的头领伊万带着象征哥伦比亚自由的玻利瓦尔之剑前来投降，埃斯科瓦尔并没有杀害他，只是说以后要加强合作。伊万走后，埃斯科瓦尔将组织的日常运转工作交给了古斯塔沃，说自己要去解放哥伦比亚。尽管哥伦比亚罪孽横生，但是有无数的人依然想要通过自己的努力让她变得更加美好，就像卡里略上校，就像康妮夫人。晚上，墨菲夫妇回到家，康妮发现自己的爱猫被悬挂在屋里，墨菲赶紧掏出手枪进屋查看。

康妮的猫被杀引起了墨菲的警觉，经过和潘那的反复推敲，得出结论是墨菲在入境的时候就被毒枭盯上了。墨菲想要就此作罢，只要能够保证康纳的安全就好，但是潘那认为缉毒局的人是不能碰的，这是规则，因为很早以前的齐奇探员牺牲自我才换得了这种认知，现在不能给与那些毒贩们翻盘的机会。虽然只是一只猫的事情，但是那也是缉毒局的猫。于是，潘那带着墨菲找到了哥伦比亚的警察苏亚雷兹，收买了他们查出墨菲的信息是被谁收买的。大量的金钱让埃斯科瓦有些飘飘然，他开始想要正式的进入政治圈。于是，他让自己的情人维莱利娅帮他找来了自由党的律师杜凯，承诺给杜凯每年三十万美金，让他去说服司法部长莱拉让他参选。本来莱拉对于埃斯科瓦尔财富的来源持怀疑态度，但是杜凯拿出一大摞的文件证明埃斯科瓦尔的钱是清清白白的，莱拉默许了。埃斯科瓦尔得到许可后，以安蒂奥基亚省前议员海罗候选人的身份正式开始了自己的选举竞演。他站在穷苦人们和弱者的一边，承诺为他们争取更多的权利，加之有大量的人手和金钱可以兑现他的诺言，一时之间埃斯科瓦尔名声大振，在民众中国呼声极高。他的妻子塔塔顶着大腹便便的孕肚支持他，很快就发现了他和维莱利娅之间的小动作。塔塔求着他不要被维莱利娅拖累，埃斯科瓦尔心疼的安慰着妻子。当晚，塔塔为她产下了一名健康的女儿。苏亚雷兹很快就抓到了机场偷取墨菲信息的两人，一番威逼利诱之下，两人说出了自己的信息是发给了一个叫毒药的人。康纳不顾墨菲的劝阻坚持要去教堂做志愿者，殊不知教堂的教父其实就是共产党人。潘那得知毒药将前往波大，说服美国大使买通卡里略上校在必经之路上设下关卡。不料苏亚雷兹得知后，转手就将消息告诉了埃斯科瓦尔，埃斯科瓦尔立即将毒药叫了回来。这次抓捕活动最终还是失败了，但是也向毒枭们传递了缉毒局对于此事的态度。哥伦比亚的大毒枭们对于埃斯科瓦尔竞选的事情意见不一，古斯塔沃依照承诺退出实验室的管理，大家都认为这是埃斯科瓦尔急于洗白自己的动作。毒枭们一致决定表面上还是支持埃斯科瓦尔的竞选，嘎查和奥乔亚兄弟对此持观望态度。埃斯科瓦尔说自己参加竞选是真的想为穷苦的人民发声，只有雷德相信他的话。竞选即将结束，海罗说自己因为健康和家庭的原因即将隐退，将自由党的接力棒叫到了埃斯科瓦尔的手上，至此，埃斯科瓦尔的一只脚已经跨进了国会的大门。潘那和墨菲告诉大使埃斯科瓦尔就是一个大毒枭，大使要求他们找人指证。两人再次找到了苏亚雷兹，苏亚雷兹将埃斯科瓦尔曾因贩毒入狱的消息告诉了他们，并且将资料管理者的联系方式告诉了他们，但是同样的他转身又将消息卖给了埃斯科瓦尔，一时之间，缉毒局和大毒枭的战争不断，潘那和墨菲终于意识到不能依靠苏亚雷兹，于是抢先找到了当年拍摄的摄影师，并把底片拿到手。大使拿着底片找到司法部长莱拉，希望由他出面指证埃斯科瓦尔。就在埃斯科瓦尔首次踏入国会的一场，莱拉当众展示了他被捕入狱的照片，公然要求他从国会辞职。埃斯科瓦尔的总统梦破灭了，但是他并没有就此一蹶不振，而是针对莱拉展开了报复和反击，在莱拉赴任捷克大使的途中将其杀害，同时，他还召开记者招待会，宣称自己是被污蔑的，原因就是他为穷人和弱者发声。

墨菲对于莱拉的死很是愧疚，谋杀莱拉的杀手被捕后招供了，供出了埃斯科瓦尔是这件谋杀案的指使人。之后，哥伦比亚政府开始全面通缉埃斯科瓦尔，同意了美国政府提出的将毒枭引渡到美国接受制裁的引渡协议，这让毒枭们开始紧张起来。墨菲和潘那希望说服卡里略帮助他们抓住埃斯科瓦尔，但是卡里略却对引渡协议并不感冒，而且说上司不会同意自己去抓捕埃斯科瓦尔，埃斯科瓦尔的资源和情报系统更加突出，总是能在警方找到他之前逃走，最关键的是埃斯科瓦尔肯定不会甘心屈服，一定会让哥伦比亚流血的。毒枭们对于哥伦比亚和美国政府达成的引渡协议非常不满，想尽方法与之对抗。嘎查雇佣了以色列的雇佣军人，乔里奥兄弟找公关公司设计了反引渡协议的图标，雷德每天在广播里大肆宣扬美国干预哥伦比亚的政局。埃斯科瓦尔更是直接写信给总统竞选人，抗议引渡协议是美国对哥伦比亚不公平的干涉。美国大使想要借此获得候选人迦兰对于引渡协议的支持，迦兰虽然内心愿意，但还是说自己会从哥伦比亚的最大利益考虑。潘那带着大使拨付的十万美金找到了哥伦比亚缉毒组哈拉米奥将军，说服他让卡里略来负责抓捕埃斯科瓦尔。但不久之后，哈拉米奥却传信来说潘那的贿赂搞反了，自己想要的是解雇卡里略，那样潘那和墨菲就会失去自己最能相信的一个警察。墨菲隐隐约约的觉得，因为埃斯科瓦尔的狂妄自大，他应该一直在等着缉毒局的人去找他。埃斯科瓦尔名下拥有了八百多套房地产，要抓住他并不是意见容易的事情。终于，警方得知埃斯科瓦尔在一座叫蛋糕的庄园里，马上触动大部队前去，但是埃斯科瓦尔还是提前得知了消息，带着家人离去，警察抓到的只是庄园的佣人和园丁。墨菲要的就是这样的结果，他希望埃斯科瓦尔知道就算自己拥有再多的房产，余生也只能在四处逃窜中度日了。值得欣慰的是，墨菲在埃斯科瓦尔没能完全销毁的资料中找到了一个位于麦德林市中心的地址，在那里他们抓到了埃斯科瓦尔的头号会计。埃斯科瓦尔的犯罪证据堆满了哥伦比亚最高法院的档案室，但哈拉米奥却不让潘那和墨菲复印证据。墨菲在资料中发现了一名美国飞行员替埃斯科瓦尔运毒，潘那让墨菲将证据塞进裤子里带走。潘那和墨菲找到了苏亚雷兹，苏亚雷兹告诉他们飞行员原本是中情局的人。墨菲和潘那找到了中情局的远飞行员巴里，在威逼利诱之下巴里将埃斯科瓦尔在尼加拉瓜装载毒品的照片。当时的尼加拉瓜手共产党的领导，美国里根政府对此十分反感，说出了对付毒枭和对付共产党一样重要的话。巴里还是悲哀的命丧埃斯科瓦尔的枪下，但是缉毒组却得到了源源不断的武器、财力、人力的支持，很快的摧毁了加之几十亿的可卡因，并在麦德林最大的制毒基地抓获了雷德。这一切在埃斯科瓦尔的眼里，觉得是美国政府的宣战。埃斯科瓦尔找到M-19的伊万，用二百五十万美金的贿赂，说伊万攻打哥伦比亚最高法院，烧毁了所有的证据。M-19的艾丽莎将消息告诉了康妮，康妮将她交给潘那，自己打电话告诉了墨菲，但是为时已晚。潘那说艾丽莎可以指控此次惨案的背后主使就是埃斯科瓦尔，但是绝对不能将她交给军方。经此一战M-19损失惨重，埃斯科瓦尔如约带来了二百五十万美金，并把玻利瓦尔之剑也交给了他，伊万本来还感动万分。埃斯科瓦尔的人趁着他们不注意，迅速将他们杀死，带走了美金和玻利瓦尔之剑。

潘那背着墨菲和艾丽莎发生了关系，想要将艾丽莎送出去，但艾丽莎称自己坚决不会离开自己的祖国，对于这个烫手的山芋，墨菲和潘那都觉得压力非凡。哥伦比亚军方分析要想揭发最高法院的大屠杀是埃斯科瓦尔指使伊万做的，那所有的证据都集中在艾丽莎和神父的身上。中情局的人说潘那有一名可以作证的证人，但是现在还没有带来。潘那和墨菲赶紧将话题转移，说他们窃听到巴拿马的来电，发现共产党的左翼势力诺列加为毒枭们提供了庇护。长时间的流亡让埃斯科瓦尔开始思念家乡了，也让毒枭们开始对埃斯科瓦产生了对立的情绪，认为是埃斯科瓦尔的原因才使得他们四处流浪。埃斯科瓦尔不得已向哥伦比亚国债局贿赂，希望可以得到特赦，但惨遭拒绝。妻子塔塔得知不能回去之后心情十分抑郁，埃斯科瓦尔说要是现在会去的话就意味着自己需要去战斗，塔塔支持他去战斗。于是埃斯科瓦尔派人暗杀了热门的总统候选人迦兰，以此宣战要回到自己的家乡去。迦兰被杀激起了民愤，大家纷纷悼念这位国家的英雄。在迦兰的葬礼上，迦兰的儿子将父亲的遗志交到了加维利亚的手中。一时间，加维利亚的电话被打爆了，他本人也陷入了深深的焦虑之中。毒枭们从巴拿马回来了，埃斯科瓦尔找来杜凯和维莱利娅，希望他们去说服加维利亚。杜凯和维莱利娅一唱一和的想要说服加维利亚，加维利亚得知了他们的真实意图，无情的将他们赶走。临走时，他们留下了埃斯科瓦尔写给加维利亚的信。潘那去找卡里略，卡里略说自己亲耳听到手下和埃斯科瓦尔交换秘密却毫无办法，因为埃斯科瓦尔可以轻易的就控制住他们的家人，而自己对此无能为力。哥伦比亚军方一直以为M-19的神父是潘那在保护，将军找到潘那说毒贩只是要人钱财，而共产党想要的却是人的全部，要是他发现潘那在保护神父，一定会控告潘那叛国罪的。潘那感到的了事态的严重，加紧为艾丽莎办理出国的手续。埃斯科瓦尔在给加维利亚的心中说，只要保证他们不再追捕毒枭，他们就绝对不会再生事端，否则的话他绝对不会饶了他们。卡里略沉迷于对埃斯科瓦尔的抓捕之中，他已经可以分辨出埃斯科瓦尔的声音，习惯，甚至能听懂埃斯科瓦尔的言外之意。但是卡里略却信不过自己手下的人，因此，他申请建立一支可以不被收买的队伍，于是搜捕队成立了。就在搜捕队紧张的训练时，毒枭们也没有闲着，他们一边大肆的购进枪支弹药，一边在各个地方招募未成年的孩子充当杀手。加维利亚的朋友罗德里戈也被埃斯科瓦尔收买，前来说服他接受六百万美金的贿赂，但加维利亚不为所动。潘那的线人维纳根特为他带来了嘎查会去卡塔赫纳的消息，潘那汇报给大使，大使让潘那去卡塔赫纳监视嘎查，墨菲被留在了原地。临走时，潘那拜托墨菲将艾丽莎送到安全的地方去，他们不知道的是中情局的人已经抓到了神父，从他的口中知道了艾丽莎和墨菲的妻子在一起。加维利亚难得和妻子过二人世界，不想还是被埃斯科瓦尔派来的杀人破坏。晚上，加维利亚看着埃斯科瓦尔的来信，接到了电话说卡里略差点就被刺杀。加维利亚陷入了恐惧之中，但又在妻子安娜的身上看到了勇气和鼓励。在记者招待会上，加维利亚宣布了支持引渡协议，正式向毒枭宣战。加维利亚的态度让毒枭们也加紧了对抗的准备。一个雨夜，卡里略打电话给埃斯科瓦尔，说虽然埃斯科瓦尔知道自己的家人在哪里，但是他也知道他的家人在哪里，这个世界总有不会被收买的人，总有一天自己会亲自找到他。

毒贩们展开了反扑，开始大肆了枪杀警察和士兵。墨菲按照潘那的吩咐准备送走艾丽莎，却在自己的车里发现了窃听器。墨菲只好假装和康妮吵架，自己骗过中情局的围追堵截，让康妮带着艾丽莎离开了，好在康妮顺利的将艾丽莎带走了。送走康妮和艾丽莎，墨菲来到了加维利亚的办公室，加维利亚公开支持了引渡协议，再经过上次的事故，加维利亚的安保工作已经做得相当的细致，但墨菲还是友好的提醒他要注重安全。现在全部哥伦比亚的人民在看着加维利亚，同样的所有的毒枭也在关注着他的行踪。潘那和卡里略带着搜捕队来到卡塔赫纳准备抓捕嘎查，卡里略对于纳维根特的真实意图感到不信任，毕竟警方嘎查能够给纳维根特的钱更多。潘那认为嘎查并不怕死，怕的是坐牢，卡里略说嘎查的武器装备和人员是自己的数倍，一旦失败就意味着会平添很多的寡妇和孤儿，所以他希望嘎查最好是死。虽然卡里略对于结果并不安心，但是他选择了相信潘那。与此同时，墨菲发现了毒药的行踪，在机场和一个西班牙人密切的接触。墨菲拿着西班牙人的照片去找苏克雷兹，在墨菲的淫威下，苏克雷兹将自己知道的都告诉了他，让他去找中情局的人。中情局原本不想理会墨菲的请求，奈何墨菲告诉他们这个人是多起恐怖袭击的炸弹专家。墨菲如愿的在中情局的绝密文件室里看到了西班牙人的资料，他突然意识到这时埃斯科瓦尔针对加维利亚的谋杀计划。嘎查对于这种风平浪静的日子感到十分的不安，他开始变得多疑起来，怀疑纳维根特已经背叛了自己。嘎查敏锐的捕捉到搜捕队来到了镇上，带着儿子和手下逃走。当卡里略带人赶到时，看到的只是被杀死的女佣带着嘎查的帽子瘫坐在椅子上。所幸的是，他们抓到了祎哥号称自己是政府议员的人，在潘那的威胁之下，那人将事情全盘托出。埃斯科瓦尔收买了贫民窟的杰米，杰米憧憬着埃斯科瓦尔承诺的美好未来，对于他的要求全盘接受，还对着埃斯科瓦尔千恩万谢，完全不知道自己即将面临怎样的结局。苏克雷兹打电话告诉墨菲埃斯科瓦尔准备在加维利亚去卡利的飞机上杀了他，还没有来得及说完整个计划，毒药进来将他残忍的杀死。卡里略带着搜捕队到托鲁去杀嘎查，此次是的潘那还是想要活捉。在一番激烈的枪战后，卡里略被嘎查的武器重伤，嘎查趁机带着儿子逃跑。卡里略及时的将消息告诉了潘那，潘那指挥着直升机对嘎查的车辆围追堵截，最终将嘎查和他的儿子杀死。毒药将杰米和带着炸弹的箱子送上了去卡利的飞机，却不想墨菲说服了即将上飞机的加维利亚，取消了卡利的行程。飞机上，无知的杰米打开了箱子，按下了录音键，瞬间所有人的眼前一片白光。

埃斯科瓦尔针对加维利亚的爆炸案病没有伤害到加维利亚，相反一百多名的无辜平民成为了受害者。此次的爆炸案引起了国际社会的广泛关注，哥伦比亚国内支持加维利亚的气势空前的高涨，最后加维利亚成功的竞选上了总统。在总统的就职晚会上，前总统说总统要比别人承认更多的压力已经做更多艰难的决定，建议加维利亚要终于自己的内心和决定。前总统的女儿图尔拜向要知道他们对于美国人的态度，前总统只是说让加维利亚小心。墨菲拍着潘那和卡里略一起找到杰米的女朋友，但是她完全否认了埃斯科瓦尔来过这里，也否认了杰米和埃斯科瓦尔有任何的联系。大家都知道她在撒谎，但现在她是唯一一个能将埃斯科瓦尔和爆炸案联系在一起的证人，他们也拿她无可奈何。但是她不知道的是，国内的局势已经容不得埃斯科瓦尔继续待下去了，和家人依依惜别之后，埃斯科瓦尔吩咐手下的人将杰米的女朋友和所有能将自己和爆炸案联系起来的人都杀死。听到这句话，后排的毒药眼神稍微有些闪烁。加维利亚兑现了抓捕埃斯科瓦尔的承诺，但是拒绝了美国的帮助，卡里略的搜捕队很快就上手开始干了，缉毒队却因为官僚主义只好袖手旁观。发动战争让埃斯科瓦尔并没有占到便宜，相反他只好和卡利贩毒集团的巴丘合作，联合两大贩毒集团来对付美国的引渡协议，不得不眼睁睁的看着自己的市场被占领。缉毒队也没有闲着，他们搞定，了埃斯科瓦尔最信赖的毒药和射手，还得知两名新人加莱亚诺和蒙卡达接手了雷德的摊子。虽然美国不能光明正大的使用监视和窃听，但是墨菲和潘那还是从卫星传回来的航拍图发现了埃斯科瓦尔的势力范围，只要追踪那些豪车就可以找到埃斯科瓦尔。埃斯科瓦尔拍杜凯前来找加维利亚谈判，说要是双方开启谈判的话，可以组织炸弹袭击和为搜捕队争取时间，加维利亚拒绝了。得知结果后的埃斯科瓦尔决定铤而走险，和古斯塔沃一起商议绑架政府高官的家人，烧毁他们的家园，破坏整个社会的安宁，这样哥伦比亚政府就不得不接受他们的条件。古斯塔沃并不赞成他的意见，但是埃斯科瓦尔坚持要一意孤行。很快，很多政府官员的家人遭到了绑架杀害，杜凯再次前来谈判，加维利亚坚持要埃斯科瓦尔释放人质并自首。埃斯科瓦尔更加残忍的杀害人质，甚至绑架了前总体的女儿知名的电视主播图尔拜，希望以此给加维利亚施压，趁机搞垮他。他想的没错，失去孩子的家长几句一堂希望加维利亚可以接受埃斯科瓦尔的条件，但加维利亚顶住压力坚决不同意。埃斯科瓦尔想通过图尔拜替自己向外界宣传自己的人道主义，图尔拜要求释放一名人质，埃斯科瓦尔照办，图尔拜也遵守约定向加维利亚传达了埃斯科瓦尔想要谈判的诚意。图尔拜的录像被寄到了总统府，前总统威胁加维利亚要是不接受埃斯科瓦尔的谈判要求，自己将不会在经济和政治上为他提供任何的帮助。无奈之下，加维利亚一面接受了谈判的决议，一方面让爱德华通知美国人追捕埃斯科瓦尔。潘那和墨菲收到了毒药去公社的消息，当他们赶到时，杰米的女朋友已经命丧枪下，毒药和神射手正在为了是否要杀了他们的小女儿而其争执。眼见着两人就要被抓住，从旁边跳出来一个拿着枪对准他们的小孩。毒药和神射手逃走了，墨菲只好将小婴儿抱回了家。

埃斯科瓦尔要在丛林中建造一座监狱，一直紧绷的神经让他开始变得多疑起来。卡里略在山里发现了埃斯科瓦尔的踪迹，墨菲和潘那也监听到埃斯科瓦尔安排逃走的路线，可是当卡里略带人赶到时，发现埃斯科瓦尔的卫星电话安安静静的挂在一头羊的身上。埃斯科瓦尔再次找到图尔拜，说服她录制视频寄给加维利亚，要求继续透明地进行谈判，要是总统坚持在美国人的帮助下抓捕他的话，他将杀光所有的人质。图尔拜的父母迫切的希望加维利亚可以接受埃斯科瓦尔的建议，将自己的女儿解救出来。但加维利亚坚持不愿意同意埃斯科瓦尔提出的自己建造监狱，让自己的人看守监狱，认为埃斯科瓦尔的意图在推翻引渡协议，着无异于和魔鬼做交易。卡里略的搜捕队找到了关押人质的地方，图尔拜被看守的人将她藏在衣柜里，却还是命丧激烈的枪战之下。图尔拜的死激怒了她的父母，他们当面指责是唯嘉丽娅杀死了他们的女儿。加维利亚面对指责陷入了深深的自责之中，决定同意埃斯科瓦尔提出的谈判。爱德华建议让美国人参与进来，遭到了加维利亚的强烈反对。对于埃斯科瓦尔的有条件投降，就连美国大使都认为是一种生理，但是爱德华激动不已，说这不是异常比赛，自己的人民只想要和平。政府的妥协让埃斯科瓦尔很兴奋，维莱利娅考虑到他承认了毒贩的身份，那就意味着自己新闻记者的身份绝对不能被他连累，所以想要和他提出分手，但是埃斯科瓦尔说维莱利娅本质和自己一样，坚决不同意分手。而另一方，潘那一直说服维莱利娅去美国暂避风头，说要是埃斯科瓦尔的事情曝光，她的名声将不复存在。政府对于埃斯科瓦尔的妥协让卡里略很有挫败感，但是他坚信一定会有和自己一样不愿妥协的警察。埃斯科瓦尔开始安排自己入狱后的生活和生意，让两个接手自己生意的人负担自己和古斯塔沃每个月的开销。然而，就是这种即将得到胜利的时候，晚上埃斯科瓦尔的家被炮弹袭击了，这让他明白，针对自己的不光有警察，还有的是自己人，因为警察不会对自己的家人下手，更不会轻易的动用炮弹。真相就是奥乔亚兄弟和卡利集团的巴丘勾结，和哈拉米奥将军达成共识，只是受了极轻的处罚，代价就是利用自己的妹妹将古斯塔沃献给警察。古斯塔沃在和奥乔亚兄弟的妹妹约会时，被卡里略的人带走。卡里略逼迫古斯塔沃供出埃斯科瓦尔的罪行，但古斯塔沃抵死不从。卡里略杀死了古斯塔沃，伪装成是他先向警察开枪造成的。古斯塔沃的死讯让埃斯科瓦尔悲痛不已，维莱利娅前来告诉他是奥乔亚兄弟勾结卡利的巴丘，埃斯科瓦尔一怒之下命人将正在打球的巴丘杀死。不幸的是，所有的球员都穿一样的一副，等他们发现巴丘是，巴丘已经顺利的逃走了。埃斯科瓦尔接受了政府送来的投降的文件，潘那和墨菲感到不可思议专门跑来观看。埃斯科瓦尔并不是向正义屈服，而是采取了一种权宜之计。墨菲在心里告诉自己，要是再有可以重创埃斯科瓦尔的机会，就算不合规矩，自己也一定要去做。

埃斯科瓦尔的监狱叫大教堂，外表看似破旧不堪，但是内部却相当豪华。源源不断的物资和美女被运送了进来，供那些和他一起坐牢的杀手们玩乐。埃斯科瓦尔将监狱建成一座城堡，可惜还是无法获得自由。埃斯科瓦尔始终不能放下古斯塔沃的死，虽然也知道现在应该和卡利集团和谈，但还是忍不住杀死了巴丘的人。墨菲和康妮收养了杰米的女儿，康妮看见墨菲在和人争吵后掏出枪 对着对方的轮胎开枪感到一阵后怕。加维利亚和夫人看着公园里人来人往一切都恢复了平静，对于自己昧着良心做下的决定稍稍感到一丝的安慰。加莱亚诺和蒙卡达找到巴丘，说明埃斯科瓦尔想要和谈的意愿，但是巴丘认为这并不是埃斯科瓦尔的作风。蒙卡达希望能够解决两派在洛杉矶的争端，出价一千二百万美金，但巴丘只愿意出价三百万。巴丘坚持认为麦德林集团已经穷途末路，但是蒙达卡提醒他现在麦德林的出口量依然是卡利的两倍。巴丘想要借由战争挑拨他们和埃斯科瓦尔的关系，但是两人还是不为所动 。蒙达卡和加莱亚诺将和谈的结果告诉埃斯科瓦尔，说巴丘对于他体现出了相当的尊重和敬佩，但是埃斯科瓦尔很快就戳穿了他们的谎言。搜捕队被解散了，卡里略被派遣到西班牙。墨菲和潘那为卡里略送行，卡里略将哥伦比亚军方低空拍摄的监狱照片拿给二人看，告诉他们现在埃斯科瓦尔的贩毒量更大了，关键的是政府对于他们睁一只眼闭一只眼，他们只需要安心的对付卡利集团就可以了。墨菲和潘那发现埃斯科瓦尔用最原始的信鸽传递消息，很快就将消息截获，以为他在监狱里挖了一条地道，来运送东西。中情局利用红外摄像机没有发现地道所在，大家都以为只是子虚乌有，很快康妮就发现了那辆运送毒枭的货车。潘那和墨菲截住派萨，在他的车里安装了隐蔽的摄像头，威逼他拍下每次运送的东西。当缉毒局的照片被送到了加维利亚的眼前，加维利亚担心的居然是缉毒局会不会把这些照片泄露给媒体。爱德华想要说服加维利亚赶紧采取补救措施，但是加维利亚觉得埃斯科瓦尔现在只能控制这座监狱，如果让他在送进去的妓女和炸弹之间选择，自己会很感激妓女的。家人来到监狱给埃斯科瓦尔过生日，席间蒙达卡的妻子一直抱怨着现在的生意有多难做。虽然她嘴上说着大家都很感激埃斯科瓦尔的牺牲，说这些都是埃斯科瓦尔应该得到的，但埃斯科瓦尔开始有了一丝怀疑，只是面上没有显露出来。埃斯科瓦尔以前藏在地底下的钱被挖了出来，农民害怕自己被牵连进去，转手将钱送给了埃斯科瓦尔的杀手副官。手下有人告诉埃斯科瓦尔蒙达卡和加莱亚诺丢掉的货刚好就只这么多钱，埃斯科瓦尔起了疑心。三人很快就闹得不欢而散，临走之时埃斯科瓦尔还是对两人痛下杀心，然后将两人的尸体肢解烧毁。维纳根特将蒙卡达和加莱亚诺的死讯告诉了巴丘，巴丘让他和缉毒局联系。维纳根特将消息告诉了潘那和墨菲，但是要求交换情报，墨菲坚决不同意。回去之后墨菲和潘那果然没有在照片中发现两人回来的身影，心中对维纳根特的消息相信了。墨菲和潘那决定用自己的办法完成任务。

埃斯科瓦尔在监狱里涉嫌谋杀蒙卡达和加莱亚诺的消息被媒体报道出来，潘那和墨菲受到了同事的赞扬，非常不幸的是，大使不用想都知道这是两人所为，在形势更加明朗之前将他们停职。加维利亚看到报道后头疼不已，爱德华安慰他这是政府结束埃斯科瓦尔假期的最好的机会。高墙之内的埃斯科瓦尔还不知道已经发生的事情，只是询问下属有没有将尸体处理干净，下属拿着报纸都不敢拿给他。哥伦比亚政府经过商议，派出了军队前去大教堂，指挥着是阿里萨将军，一名麦德林人。塔塔看到军队朝着大教堂开区，赶紧通知了埃斯科瓦尔。埃斯科瓦尔接到电话时军队已经出现，他安慰塔塔自己会没事的，然后让手下的人准备好武器。军队将大教堂四周围得水泄不通，胡安要去监狱帮埃斯科瓦尔，被塔塔狠狠的教训，她们都不愿意相信 埃斯科瓦尔会有事。埃斯科瓦尔和下属商量着应对之策，他还是希望能通过和加维利亚谈判将事情和平的解决。埃斯科瓦尔派遣爱德华前来假意和埃斯科瓦尔谈判，说服他转移到由军方控制的波哥大监狱。墨菲被人在车库前劫走，康妮只好找来潘那帮忙。潘那自己没有找到墨菲，只好向中情局求助 ，但还是没有消息。中情局建议立即上报，但潘那坚持再拖延几个小时，因为他还不知到底是卡利集团还是埃斯科瓦尔劫走了墨菲，害怕贸然上报会让墨菲面临和图尔拜一样的结局。爱德华不惜只身犯险，向埃斯科瓦尔说明要将他和手下送到波哥大的监狱，美其名曰是为了保护他不受其他犯罪团伙的伤害。埃斯科瓦尔坚持是加维利亚和爱德华背叛了自己，说自己根本就没有杀人，谁会保证自己出去不会被绑架到没过去，要真是加维利亚的意思他就应该自己来，否则任何人的擅入他都会视为宣战。爱德华被埃斯科瓦尔前行扣押在大教堂，阿里萨将军苦苦的在外等待。埃斯科瓦尔要爱德华打电话给加维利亚，让他马上将军队撤出去。加维利亚接到电话后，想不通为什么爱德华会进到监狱里，为什么阿里萨将军迟迟没有动手。所有的人都让加维利亚挂掉电话，不给埃斯科瓦尔威胁自己的机会。加维利亚十分担心爱德华的安危，埃斯科瓦尔趁机挑拨两人之间的信任。墨菲被带到了巴丘的面前，巴丘拿着墨菲的录音和照片威胁他，希望它能团结那些被伤害得人共同对抗埃斯科瓦尔。墨菲不为所动，说自己是想扳倒埃斯科瓦尔，那是在那之后会对付卡利集团了。巴丘将墨菲送了回去，墨菲抓着潘那的衣领问他是不是他出卖了自己，潘那当然不承认。晚上，军队闯入了大教堂，与毒贩们展开了激烈的战斗，成功的救出了爱德华，并及时的将消息报告给加维利亚。埃斯科瓦尔从大教堂逃出去不到一个小时哥伦比亚流言四起，但是这次没有妥协和谈判，有的只是一击必中的决心。（第一季本季终）

大毒枭埃斯科瓦尔越狱，政府派出军队全力围剿，看来会使埃斯科瓦尔无法逃脱的人力，却碍于军队人员惧怕埃斯科瓦尔的庞大势力，而让埃斯科瓦尔安然无恙地逃出政府的围剿，埃斯科瓦尔越狱成功。美国缉毒队警探墨菲的妻子康妮为墨菲负责埃斯科瓦尔案件的危险性而与墨菲起争执，墨菲极力安抚妻子康妮情绪时，搭档潘那来电通知墨菲:埃斯科瓦尔越狱成功一事。哥伦比亚政府为埃斯科瓦尔越狱一事召开高层会议，将此事交给了皮松上校负责。埃斯科瓦尔回家与家人团聚，安抚妻子一切都会好的。而此时的麦德林布满了搜捕埃斯科瓦尔的警察们，全城进入戒备。另一方面，并不待见美国人的皮松上校处处为难负责埃斯科瓦案件的美国警探墨菲与潘那。埃斯科瓦尔安排好转移实验室后，不顾手下阻拦要求找一个案底清白且车技好的车手带他绕城，为了让人们知道埃斯科瓦尔并非缩头乌龟。与埃斯科瓦尔有杀夫之仇的朱蒂想要把越狱后的埃斯科瓦尔干掉，脱离麦德林集团的伯纳助朱蒂一臂之力，伯纳提议将他们的实验室暂时关掉，直至埃斯科瓦尔被干掉，而他们的搭档海密不仅不关掉实验室，还想与麦德林集团中的墙头草里卡多合作，将实验室地址告知里卡多，结果海密被埃斯科瓦尔所杀害，得知消息的伯纳与朱蒂痛苦万分。埃斯科瓦尔手下奇卡找来在红灯区为妓女开车且案底清白的利蒙为埃斯科瓦尔效力，利蒙提议让玛丽萨在后座上做掩饰，利蒙按照埃斯科瓦尔的路线开始了绕城。另一方面，警局接到了某一个妓女的线报，墨菲出动去抓捕奇卡，但墨菲却接到妻子康妮来电，受够了危险威胁的康妮要带着女儿离开麦德林到朋友家去居住，墨菲赶到机场去，被告知飞机已起飞，气急的墨菲在厕所殴打了吸毒的人，被警方带走。留下缉拿奇卡的伯纳，缉拿失败。埃斯科瓦尔因救济贫困的人们而深受他们的爱戴，被贫困区人们尊称为大圣人。埃斯科瓦尔通过杜凯，告诉总统先生他愿意协商重返大教堂的条件，总统先生通过电视告诉埃斯科瓦不可能谈判，并拿出巨额悬赏金号召群众一起抵抗埃斯科瓦尔。

逃出潘那缉拿的奇卡，返回到红灯区枪杀了妓女们，以此作为她们出卖他的代价。埃斯科瓦尔在看完哥伦比亚总统戈维利亚拒绝谈判的电视以后，通过采访的方式告诉总统先生协商一事。与此同时，反恐的美国总统布什派出人手到哥伦比亚负责埃斯科瓦尔案件，共同扳倒埃斯科瓦尔。难搞的摩西娜成了墨菲和潘那的Boss，摩西娜第一件事就是处理墨菲殴打华尔街混蛋的事，潘那为此在摩西娜面前尽力说墨菲好话，得已挽回局面。摩西娜警告墨菲不要再惹事，否则就让他回去迈阿密。埃斯科瓦尔寻找朱蒂实验室无进展，交待手下一定要尽力找到朱蒂。埃斯科瓦尔的采访使得首席检察官格里夫接见了杜凯，格里夫告诉杜凯他愿意与埃斯科瓦尔进行交易。得知此事的爱德华副总统前去找格里夫理论，格里夫告诉爱德华他并非总统的手下且他有理由怀疑埃斯科瓦尔越狱那天爱德华在大教堂现场是在帮埃斯科瓦尔潜逃，两人谈话不欢而散。皮松上校把麦德林包围了起来，并开了一天举报埃斯科瓦尔的热线，但并没有得到什么实际有用的线索。杀光妓女的奇卡坚持一个也不能放过，要把玛丽萨也枪杀，利蒙于心不忍帮助玛丽萨逃过了奇卡的追杀。费尔南多说服埃斯科瓦尔可以试试放弃与总统协商，换成与首席检察官格里夫做交易。埃斯科瓦尔妻子塔塔表示她想离开哥伦比亚，她不愿再过着东躲西藏的生活。美国缉毒队这边得知奇卡收马桶的线索后，通过情报支援特遣队搜索到埃斯科瓦的杀手维拉斯科的通话，锁定了埃斯科瓦尔居住的地址。摩西娜去找皮松上校要求支援被拒，摩西娜最后通过克洛斯比使得皮松上校不得不支援摩西娜，但皮松上完拒绝偷偷潜入包围埃斯科瓦尔，而是大张旗鼓地包围埃斯科瓦尔，结果导致抓捕埃斯科瓦尔失败。经过连夜躲避警察的塔塔再次向埃斯科瓦尔表达她的担心，埃斯科瓦尔安抚塔塔。本为协商极力容忍麦德林四处充斥了皮松上校手下警察的埃斯科瓦尔，经过大半夜逃窜后，决定向政府开战，进行了对警察的恐怖袭击。在这次恐怖袭击中，利蒙第一次开枪杀人，警察死伤惨重。

埃斯科瓦尔的开战杀死了30名警察，牺牲警察的家属伤心不已，为此皮松上校辞职，总统戈维利亚认为自己也承担大部分责任，为对抗埃斯科瓦尔，总统先生把埃斯科瓦尔唯一惧怕的人——卡里略上校调回了麦德林。埃斯科瓦尔找到了朱蒂的住处，但朱蒂早已离开住处，埃斯科瓦尔逼问朱蒂的手下朱蒂的去向以及实验室点。而此时的朱蒂来到了第二大毒枭吉尔伯托家中，朱蒂想要吉尔伯托与她联合起来干掉埃斯科瓦尔。一直把卡利集团背后的毒品生意伪装得很好，以及对埃斯科瓦尔退步到纽约市场的两兄弟，觉得不能正面与埃斯科瓦尔抗争，而应低调行事，并且借助卡里略上校回来这一点来对付埃斯科瓦尔。卡里略上校回到麦德林指挥后，一切行事风格都进行了改变，卡里略上校有条不紊地指挥手下对抗埃斯科瓦尔，卡里略上校先让大部队将埃斯科瓦尔区包围，在埃斯科瓦尔壁画上撒尿以此方式告诉埃斯科瓦尔他回来了。再利用大部队出动来迷惑埃斯科瓦尔的眼线们，以此通过追踪定位到各个眼线的位置，再出动小部队将每一个眼线逐一攻破。卡里略用“杀一儆百”方式警告其他眼线为埃斯科瓦尔卖命的下场，并让其中一位小男孩带一颗子弹给埃斯科瓦尔，以此警告埃斯科瓦尔。美国警探潘那对卡里略枪杀眼线中的孩子无法理解，但他又别无他法，因此懊恼不已。同样得知卡里略回麦德林的塔塔告知埃斯科瓦尔他们如今的处境是充斥着危险性的，埃斯科瓦尔向塔塔保证万一事情脱出他所能控制范围时就离开哥伦比亚，以此来安抚塔塔的情绪。另一方面，奇卡仍旧坚持不懈寻找玛丽萨，但无果。朱蒂为向埃斯科瓦尔报仇牺牲了自己最大的实验室作为诱饵，让埃斯科瓦尔知道最大实验室的地点，同时通过伯纳将此线索提供给潘那，卡里略上校安排人手拿下了此实验室，缉拿了埃斯科瓦尔的手下盖托，但并没有从盖托口中得知埃斯科瓦尔的下落。目睹了卡里略将埃斯科瓦尔手下杀掉的墨菲，心里有了不小的冲击，墨菲给妻子康妮打电话，以此缓解。埃斯科瓦尔让带着子弹来找他的小男孩大卫，通过录制采访的方式告知人们卡里略是一个无情杀害孩子的恶魔，希望以此对哥伦比亚政府造成舆论冲击，让人们都站在他这边。

随着卡里略上校有条不紊实施计划并取得成效，大卫被采访的视频播出后，哥伦比亚政府与美国那边都无动于衷，这让埃斯科瓦尔愈发不冷静，并噩梦缠身，最后埃斯科瓦决定写信阐述卡里略上校是多么混蛋，并投给最有影响力的报社，但并未被刊登。卡里略上校端了埃斯科瓦尔所占的朱蒂的另一个实验室，墙头草里卡多据点被警察所包抄，只有里卡多一人成功逃出。随着卡里略上校打压埃斯科瓦尔势力不断得取得进展，卡利集团开始筹备如何接手没有埃斯科瓦尔以后的市场，并打算最后将朱蒂交给埃斯科瓦尔。埃斯科瓦的帝国看似即将坍塌，更雪上加霜的是因埃斯科瓦尔资助游击队得罪了右翼卡斯塔诺，卡斯塔诺也加入了对抗埃斯科瓦尔的联盟中。卡斯塔诺向卡利集团提出联合对抗埃斯科瓦尔，被巴丘给拒绝了。利蒙找到玛丽萨，告诉玛丽萨他愿意和她一起背叛埃斯科瓦尔，为了他们的安全，作为埃斯科瓦的司机，利蒙可以将埃斯科瓦尔的行踪告诉玛丽萨，然后让玛丽萨将此消息告知给警探。通过警探潘那的情人，玛丽萨将这个计划告诉了潘那，通过潘那将此事告知了卡里略上校，卡里略上校信任潘那，并由无线电确认了埃斯科瓦尔确有的地址后，卡里略上校出发抓捕埃斯科瓦，要一同前去的墨菲和潘那被摩西娜所拦下。殊不知，这是利蒙为了玛丽萨的安全所设计的圈套。前去的卡里略上校则中了埃斯科瓦尔的计谋，被埃斯科瓦尔所枪杀，得知卡里略上校被杀后的潘那十分自责。另一方面，副总统爱德华收到了总检察官格里夫的船传票，为审问埃斯科瓦尔在四百人围捕下逃出大教堂一事。卡里略上校被杀一事引起争议，副总统爱德华自愿提出当这个事件的替罪羊，保住总统先生的名望。得知卡里略上校被埃斯科瓦尔亲手所杀得卡利集团重新考虑与卡斯塔诺联合一事。杀死卡里略上校之后地埃斯科瓦尔与妻子塔塔一同庆祝，塔塔将担心之事都放下了。卡里略上校的死让玛丽萨得到了安全，达到了利蒙所想要的结果。卡里略上校的死对墨菲冲击甚大，并有条不紊的进展戛然而止，墨菲在妻子康妮怀里崩溃大哭。与此同时，同样崩溃的潘那被伯纳接到了蒙蒂赌场。

朱蒂试图说服美国警探潘那与他们合作，干掉埃斯科瓦尔，但被潘那拒绝，朱蒂最后把玛丽萨的住址交给潘那以示诚意，劝说潘那再好好考虑。卡里略上校死后，搜捕队失去了领头羊，失去了抓捕的方向。但抓捕埃斯科瓦尔的计划不能废除，为此总统先生戈维利亚为此再寻找了一个合适的人选——马丁内斯上校。虽然马丁内斯上校并不愿意，但被迫于儿子的原因，接受了这个决定。另一方面，杀掉卡里略上校，势力重新稳定下来的埃斯科瓦尔将塔塔哥哥卡洛斯接了回来，决定继续开工，并把在美国为他周转的得力助手狮子召回。潘那拿着地址找到了玛丽萨，玛丽萨表示自己从头到尾被利蒙蒙在鼓里，而后潘那重使利蒙的计谋，利用玛丽萨引出利蒙，再由利蒙跟踪到了埃斯科瓦尔手下维卡斯科，碍于人少出于劣势的潘那请求哥伦比亚政府支援，但无法立刻就得到支援，孤立无援又抓捕心切的潘那不得已请求朱蒂那边的支援，最终成功拿下了维卡斯科。维卡斯科被伯纳所带回，经过伯纳的拷问，虽然没有有关埃斯科瓦尔的下落，但维卡斯科供出了狮子的事情、埃斯科瓦尔军力和财力以及埃斯科瓦尔会计师的地址。隔天到达的狮子被卡利集团所节所接走，进行了谈话之后，狮子坐飞机回去，并告知埃斯科瓦尔:维拉斯科没有到机场接他。而对于潘那询问维拉斯科审问结果时，伯纳却对这些事情闭口不提。埃斯科瓦尔家中，塔塔为全家人的团聚准备大餐中，哥哥卡洛斯向塔塔表示自己的担心，塔塔宽慰哥哥。而接受搜捕队的新队长马丁内斯上校收到了来自埃斯科瓦尔的骨灰盒警告，马丁内斯上校将此事告知年轻气盛的儿子，让他认清埃斯科瓦尔的恐怖性。新对象马丁内斯上校就任后发布实施地毯式搜索，潘那对此无法理解。康妮和墨菲安抚完卡里略上校妻子后，康妮将离开麦德林，嘱咐墨菲注意安全。与朱蒂战线合作的潘那，将埃斯科瓦尔的有关信息给了伯纳，卡斯塔诺兄弟由此对埃斯科瓦尔的手下展开了大捕杀，并将维拉斯科悬挂以示威。埃斯科瓦尔的手下奇卡将市里的情况告知埃斯科瓦尔，卡斯塔诺暗处出击的方法制约住了埃斯塔诺基亚，埃斯科瓦尔决定离开现在的住址。

以“巴勃罗受害者反抗组织”为名的卡斯塔诺兄弟毁掉了埃斯科瓦尔与古斯塔沃生前玩车的地方，继续着对埃斯科瓦尔的报复，埃斯科瓦尔由里卡夫提供的暗杀团线索推测出朱蒂与卡利集团联手对抗他，不确定的埃斯科瓦尔决定先放出风声恐吓这些人。而“巴勃罗受害者反抗组织”不仅没有停止他们恶劣的复仇行动，而且愈演愈烈。哥伦比亚政府因此召开大会，对“巴勃罗受害者反抗组织”应该采取怎样的行动，总统先生表示等时机一到自然会除掉这个组织，但他们现在主要是先解决埃斯科瓦尔。CNP窃听到埃斯科瓦尔手下的行踪，与朱蒂联盟合作的潘那将此消息透露给了伯纳，埃斯科瓦尔手下杰罗先一步被“巴勃罗受害者反抗组织”所抓获。墨菲对此向潘那提出疑虑，潘那闭口不提合作之事。潘那不断为伯纳提供警探们所拥有的情报，卡斯塔诺兄弟与警员撞上，马丁内斯上校儿子小乌戈不对他们放行，差一点发生火拼，好在潘那及时赶到，阻止了，墨菲因此知晓了潘那与他们合作的事，马丁内斯上校因此将儿子送去相对安全的办公室工作。“巴勃罗受害者反抗组织”的做法被媒体所刊登，卡利集团对“巴勃罗受害者反抗组织”的高调做法提出质疑。拥有医生执照的卡里夫在医院找到被自己打伤的卡斯塔诺手下，逼问出他们的老大，埃斯科瓦尔由此知道了联盟成员，打算进行报复，知道埃斯科瓦尔恐怖计划的卡洛斯劝妹妹塔塔带着孩子离开埃斯科瓦尔，被塔塔拒绝。劝不动塔塔的卡洛斯劝埃斯科瓦尔为了她们母子的安全把她们送出哥伦比亚，同样被拒，埃斯科瓦尔保证会使她们安全。埃斯科瓦尔在吉尔伯托女儿婚礼时，炸掉了婚礼现场，给卡利集团做出警告，而埃斯科瓦尔的这一行为将吉尔伯托彻底惹怒。随着圣诞节的到来，埃斯科瓦尔母亲打算带孩子们去麦德林教堂做祷告，被塔塔与埃斯科瓦尔所阻止。但埃斯科瓦尔母亲不死心，自己让手下曼努埃送自己去做弥撒，得知后的埃斯科瓦尔与塔塔在家焦急等待，埃斯科瓦尔母亲果然被“巴勃罗受害者反抗组织”的手下跟踪，双方进行火拼，卡洛斯在这次火拼中中枪身亡。逃出后的埃斯科瓦尔决定将母亲、塔塔和孩子们送出哥伦比亚，然后放开手脚与敌方作战。

开始反抗的埃斯科瓦尔将卡利集团所经营的连锁药店炸掉，埃斯科瓦尔此举使波哥大陷入恐慌，但“巴勃罗受害者反抗组织”并没有为之所动，而是变本加厉地对此进行回应，两方的斗争使百姓陷入恐慌。“巴勃罗受害者反抗组织”的下一个目标是费尔南多，却被费尔南多侥幸逃过。鉴于卡斯塔诺兄弟的滥杀无辜行为，潘那决定不与他们合作，拒绝再提供信息给他们。伯纳对此表示支持潘那不滥杀无辜的原则，但卡斯塔诺兄弟的做法他无法阻止。惊慌失措的费尔南多打算带着已经离婚的妻子和儿子离开哥伦比亚，却被妻子拒绝，情急之下的费尔南多去把在校的儿子接走，两人藏身起来。另一方面，潘那让情报支援特遣队跟踪费尔南多的位置。埃斯科瓦尔为了家人的安全，预定了多趟航班以此来掩人耳目，一家人依依不舍分别后，埃斯科瓦尔因压力过大而晕倒。得知埃斯科瓦尔要将家人送出国的美国人要哥伦比亚总统动用关系阻止，总统表示这是他们的合法权利，美国大使告知总统这其中的利害关系，哥伦比亚总统被说服，接受美国大使的建议。摩西娜派出墨菲一路跟踪埃斯科瓦尔的家人，墨菲对潘那闭口不提此事。得知埃斯科瓦尔家人即将逃往德国的美国人与德国那边交涉失败，不得已的墨菲只好使用其他方法禁止埃斯科瓦尔家人入境。与此同时，费尔南多的地址被检测到，因费尔南多儿子也在场的原因，潘那拒绝向伯纳提供费尔南多的位置并向摩西娜报告此事。潘那打算以安全来作为说服费尔南多与他们合作的筹码，并也成功了。但费尔南多的藏身位置被痛恨埃斯科瓦尔的警员特鲁希略告知了“巴勃罗受害者反抗组织”，费尔南多与他儿子还是没能逃过被杀。而潘那则被“巴勃罗受害者反抗组织”的背后怂恿者——上司卡尔以伯纳名义约出来进行交谈，潘那对此无能为力。墨菲成功阻止埃斯科瓦尔家人入境德国，得知这个消息的埃斯科瓦尔大怒，通过电话对德国进行了恐吓，走投无路的埃斯科瓦尔最终向首席检察官格里夫求救，总检察长对埃斯科瓦尔家人进行保护性监禁。并安排手下在离总统宫殿最近的地方放置炸弹，无辜百姓再次受到伤害。

埃斯科瓦尔继续着他的恐怖行动，在他把220磅炸药放置波哥大购物中心，造成惨重伤害后，彻底惹怒群众，再也没有拥护埃斯科瓦尔的群众。总检察官格里夫以将他的家人送出哥伦比亚为条件要求埃斯科瓦尔停止暴行，向政府投降。通过媒体得知埃斯科瓦尔即将完蛋的卡利集团前去迈阿密收服之前埃斯科瓦尔所拥有的市场。以保护性名义被监禁的塔塔无法联系埃斯科瓦尔，她与埃斯科瓦尔母亲赫梅尔达商量应做些什么。随着埃斯科瓦尔组织的瓦解，搜捕队抓捕埃斯科瓦尔的时机已到，马丁内斯上校发表了自己的意见。随着事情脱出可控范围后，潘那让墨菲为自己准备好后路。监视埃斯科瓦尔家人是否安全的布莱基出于善心，告诉埃斯科瓦尔他的家人都很安全，然而他并没有看见埃斯科瓦尔的家人。随之，布莱基被捕。另一方面，朱蒂前去劝说盖昂帮加入他们，盖昂帮被说服，但此事被盖昂帮的马仔告知了奇卡。埃斯科瓦尔决定在盖昂帮去蒙蒂赌场，与之决战。与此同时，审问布莱基的潘那与墨菲虽说没有得到埃斯科瓦尔的下落，但得到了奇卡的信息。而因为收买了狮子，前去迈阿密收服市场的巴丘进行得十分顺利，迈阿密市场彻底被收服后，狮子被杀。塔塔向维莱莉娅求救，维莱莉娅给塔塔带去了埃斯科瓦尔托付的无线电话与现金，塔塔与埃斯科瓦尔终于联系上。随着布莱基把奇卡供出来，搜捕队对缉拿奇卡制定了一系列计划。另一方面，要求总统先生安置埃斯科瓦尔家人的总检察长格里夫，被总统先生拒绝。维莱莉娅被“巴勃罗受害者反抗组织”所杀的消息与迈阿密失守的消息同时传来，埃斯科瓦尔大怒，要与他们联盟正式开战。奇卡与里卡多带着会计罗哈斯前去拿钱，这一路上奇卡不断被潘那以电话来进行追踪，意识到情况不对劲的奇卡，将里卡多与罗哈斯杀掉，打算自己带着钱逃走，但被搜捕队所围捕成功。埃斯科瓦尔最得力手下奇卡被捕，由于奇卡想要重新开始新生活，潘那与墨菲承诺与他们合作，就能帮助他开始新生活，最终奇卡同意与警方合作，供出组织时间地点。另一边，埃斯科瓦尔与利蒙已出发，途中接到了被警方指使打来的奇卡的电话，埃斯科瓦尔意识到不对劲之后，与塔塔通话并告知近期无法再通话，对其他事情闭口不提，通完话后埃斯科瓦尔让利蒙开往另一条路，告诉利蒙，奇卡他们都离开了。埋伏的警方再一次错过抓捕埃斯科瓦尔。

埃斯科瓦尔的帝国摇摇欲坠，大势已去的埃斯科瓦尔，回到了乡下父亲家中，开始了人间蒸发，搜捕队无法捕捉到任何关于埃斯科瓦尔的信息。而“巴勃罗受害者反抗组织”事件也在被解决，毒枭界重新洗牌中。坐收渔翁之利的卡利集团挑拨卡斯塔诺兄弟与朱蒂的关系，卡斯塔诺兄弟打算杀掉朱蒂做麦德林头号毒枭。外出的朱蒂，收到卡斯塔诺兄弟的炸弹袭击，但好在逃过一劫。伯纳叫来潘那，朱蒂以潘那作为一个联邦警察泄露情报机密为由要挟潘那要帮她除掉卡斯塔诺兄弟。潘那要朱蒂配合他，作为一个缉毒所的线人，帮助他们抓捕卡利集团。另一方面，长久无法联系到埃斯科瓦尔的塔塔万分焦急。而塔塔一直用无线电话试图联系埃斯科瓦尔的场景被看守的人发现，此人恰好是特鲁希略的朋友，通过特鲁希略将此事告知墨菲，与马丁内斯上校商量抓捕埃斯科瓦尔之事。回到父亲家中的埃斯科瓦尔，帮忙父亲干农活，与牛羊为伴。与此同时，潘那与摩西娜商量朱蒂一事，摩西娜应允潘那，提醒潘那有人并不喜欢这一档事。而不喜欢这一档事的卡尔，早将一切看在了眼里。伯纳无法容忍一个告密者，于是伯纳与卡利集团达成共识，将朱蒂送出了哥伦比亚。潘那则被卡尔告知摩西娜被调职，而潘那自己也得准备回国，潘那对着一切无能为力。与父亲一起干活的埃斯科瓦尔，提议要带着孩子住在离父亲不远的地方，养一群牛羊，开一个牧场...而埃斯科瓦尔父亲无视埃斯科瓦尔的话语，两父子敞开心扉谈话，埃斯科瓦尔的父亲告诉埃斯科瓦尔，他以有他这个儿子为耻，尽管这很心痛，埃斯科瓦尔打算离开父亲的家。埃斯科瓦尔让利蒙去取藏于树下的钱，准备离开，但不幸的是钱都烂掉了。为了搞到钱，利蒙找到了玛丽萨，翻遍了才找到一点钱，玛丽萨于利蒙发生口角，利蒙为之前玛丽萨欺骗他之事怀恨在心，冲动之下开枪杀死了玛丽萨。总检察官格里夫劝塔塔，如果联系到埃斯科瓦尔，应劝说他投降，法律才是他们最后的希望。埃斯科瓦尔把利蒙带来的钱留给了父亲，也把自己和父亲的合照留下，埃斯科瓦尔和利蒙离开乡下。埃斯科瓦尔来到有信号的地方，与塔塔联系上。

在埃斯科瓦尔44岁生日这天，埃斯科瓦尔做了一个梦:埃斯科瓦尔从总统先生戈维利亚手里接任了下一任总统权。潘那最终因为与“巴勃罗受害者反抗组织”私下有来往而被遣送回国，潘那嘱托墨菲一定要抓住埃斯科瓦尔，最后带着不能亲手抓捕埃斯科瓦尔的遗憾而离开。埃斯科瓦尔与利蒙躲藏在麦德林的一处普通的民区生活，小心翼翼地购置生活必需品，利蒙为埃斯科瓦尔求了一枚护身符。而埃斯科瓦尔与塔塔都不知道他们的通话全部被搜捕队窃听到，得知埃斯科瓦尔躲藏在麦德林的马丁内斯上校开始布置抓捕埃斯科瓦尔的行动计划。另一方面，看护塔塔母子的人员告知塔塔总检察官格里夫即将撤离对他们的保护，劝说塔塔要好好考虑她们母子的安全。出于对孩子们的安全考虑，塔塔劝埃斯科瓦尔自首，宽慰埃斯科瓦尔自首并不代表尽头。而这一切对话，被中尉小乌戈窃听中，并定位到了埃斯科瓦尔的位置。知道塔塔劝埃斯科瓦尔的赫梅尔达要离开酒店去到埃斯科瓦尔身边，陪伴他。马丁内斯上校出动搜捕队前去抓捕埃斯科瓦尔，但因湖面反射信号，导致搜捕失败。中尉小乌戈意识到问题所在之后，继续重新定位埃斯科瓦尔位置。而埃斯科瓦尔则在众目睽睽之下，游荡于麦德林街区，竟无人认出他，在此期间，与表哥古斯塔沃进行了一次对话。对话之后，埃斯科瓦尔做出了打算，他可以接受记者的采访，但绝不投降。在埃斯科瓦尔与塔塔通话期间，中尉小乌戈再次追踪到埃斯科瓦尔的位置，并目睹埃斯科瓦尔打电话场景。马丁内斯上校下令让驻点剩下的人赶过去，搜捕队成功射杀埃斯科瓦尔与利蒙，埃斯科瓦尔当场被杀。通过媒体将埃斯科瓦尔被射杀一事公布于众，民众一片欢呼，赶到现场去的赫梅尔达伤心欲绝，告知媒体埃斯科瓦尔作为儿子，十分优秀。同样通过媒体报道得知的塔塔，泣不成声。塔塔听从埃斯科瓦尔生前的建议，求助吉尔伯托无果。被遣送回国的潘那得知埃斯科瓦尔被杀过，十分欣慰，然后潘那以为要接受审查委员会的调查，却不知来的是指挥部，他们要潘那配合缉毒局抓捕卡利集团。（第二季本季终）

潘那回到老家参加婚礼，大家对于这个从哥伦比亚回来的英雄充满了敬意，就连前女友洛林也接受了他的道歉，说自己早就原谅了他，看着洛林和丈夫兰迪恩爱有加，潘那还是忍不住的回头多看了几眼。回去的路上，父亲发现潘那的情绪不对，告诉他从小就想着要走出去改变世界，但是不要着急更多的是世界改变你。潘那从不认为自己是英雄，真正的英雄是那些被掩埋在地下的灵魂，以前为了对付麦德林集团和卡利合作，但是现在卡利集团已经是自己的头号敌人了。埃斯科瓦尔死后，卡利集团瞬间就跃居到贩毒制毒的第一名。不同于埃斯科瓦尔的高调张扬，他们和哥伦比亚的精英人士为伍，藏在暗处缓缓磨刀，把所有的事情处理的合法合理把毒品贩卖经营的就像世界五百强的企业一样。在卡利集团的内部也分工明确，巴丘负责分销和安保工作，齐皮负责他们在美国纽约的生意，米格尔则管理着集团所有的资金往来，包括贿赂官员政客，CEO吉尔伯托被称之为棋手，有着聪明的大脑运筹帷幄。现在卡利集团彻底的暴露在了缉毒局的面前。潘那回到了缉毒局，因为埃斯科瓦尔案件升职了。新的美国大使告诉他哥伦比亚新总统上任，不像加维利亚那么好控制，要他慢慢的推动工作。潘那担心新任的中情局站长斯特科纳会不支持自己的工作，大使说潘那的调令就是他签署的，现在中情局和缉毒局的目标一致，要二人精诚合作。缉毒局从没有放弃对卡利集团的关注，最近他们从一个叫基石计划的行动中收益，得知卡利集团将在明晚举办宴会，到时候会宣布下一步的部署。缉毒局的人找到一个被关押在美国的毒贩的弟弟安德烈斯，让他充当线人进入宴会现场偷拍，安德烈斯想救回自己的哥哥只好照办。卡利集团也没有闲着，豪尔赫将安保工作做得滴水不漏，已经憧憬着自己从卡利集团离开之后的生活了。宴会上，吉尔伯托宣布卡利集团已经和政府在进行谈判，将会在六个月后交出所有的贩毒路线、安全屋等有关贩毒的一切线索，所以在未来的六个月里，大家可以尽情的赚钱，所有的利润现场的人见者有份。毒贩们对吉尔伯托单方面的决定有些不满，但又不敢在他的面前表露出来。克劳迪托的女伴玛利亚引起了米格尔的注意，米格尔的目光始终追随着她的身影，将她和克劳迪托的矛盾看的一清二楚。豪尔赫发现了偷拍的安德烈斯，将他带到监控室揭穿了他的企图，让他自己悄无声音的在卡利消失。米格尔得知后夸赞了豪尔赫，说自己不能接受人才的流逝，要豪尔赫再呆最后的六个月。潘那得到了同事的警告，说卡利集团将会和政府谈判，所以会平静一段时间，劝潘那不要妄想再去以卵击石，那是不切实际的。果不其然，缉毒局的探员并没有收到安德烈斯拿回来的现场照片，相反的自己被监视了起来。卡利集团每年用几十亿的金钱，在全球各地布满了眼线，他们不光监视着政府官员的一举一动，同样的就连自己的合作伙伴也没有放过，一旦得知合作伙伴对自己不满或不利都是杀无赦。克劳迪托兄弟在外面玩乐，巴丘带人将他捉住活生生的肢解。一如卡利集团的一贯作风，低调让人找不到证据。

卡利集团利用氯气来转换可卡因，却在搬运的过程中不小心将罐子打破，氯气渗透了出来，致使云博地区四名孩子遇难。新闻记者卡罗琳娜敏锐的发现了其中的不妥，向士兵西尔维奥打探消息，西尔维奥让她去找地区安全检查员。缉毒局的达菲和洛佩兹监视卡利集团的照片被放到了报纸上，哥伦比亚军方对于美国不按照约定和规矩办事感到十分的不满，尽管大使和潘那一直保证这类的事情以后不会再发生，但是军方还是收回了达菲和洛佩兹的护照，美国方面只好将他们调回美国。达菲和洛佩兹对此毫不知情，潘那给他们看报纸也只是觉得那是正常的兵家胜负而已，直到潘那告诉塔米即将要回到美国，两人还坚持要说服潘那让那个塔米留下。吉尔伯托不愿让儿子插手自己的生意，一心想要把他培养成家族企业明面上的商业领袖。当云博地区的新闻发生后，吉尔伯托对此勃然大怒，认为这会被政府当成是他们不愿谈判的信号，那么他们之前的所有人力金钱都会白费。齐皮打来电话，说纽约市场生意红火，但是缺乏转换可卡因的氯气，吉尔格托拜托他一定要先保持低调。正在和家人商量着如何盖房子的豪尔赫被中途叫了过来，吉尔伯托吩咐他们一定要处理好这件事情。豪尔赫拿到了安全检查员的资料，让手下二十小时无死角的监视好他，希望能够找到他的弱点。缉毒局新来的菲斯特一心想要做出成就，他将自己收集的卡利集团的情报拿给潘那，申请调到卡里小组去工作。潘那拒绝了他的要求，说卡利小组现在没有一个人，自己也不会调任何一个人去卡利小组。安全检查员的确是一位清廉的官员，并且完全的不贪。但是豪尔赫再监听电话中发现了他的妻子出轨偷情的对话，于是在他们约会的房间安装了摄像机，将他的妻子和别人缠绵的视频都拍了下来。当豪尔赫把他们找到的东西交给吉尔伯托时，吉尔伯托对他的办事效率很是赞赏。一旁的戴维阴阳怪气的让豪尔赫去说服安全检查员，将氯气泄漏造成的事故说成是市政工程的问题。豪尔赫当然推辞，说自己本来就不善言辞，但吉尔伯托支持了戴维的意见。卡罗琳娜接近潘那，向他询问云博地区的真实情况，问是不是因为卡利集团向埃斯科瓦尔案件提供了资金所以才不再调查，潘那不愿回答，让她去问新闻发言人。卡罗琳娜说云博地区的毒气泄漏已经造成了死亡，其中不乏儿童，不管真相如何，今天安全检查员都会宣布是市场工程出的错。潘那也不好反驳，只有自己默默的上楼去。豪尔赫找到安全检查员，将他妻子偷情的照片拿给他，安全员不为所动，说自己早就已经在知道了，但是豪尔赫没有就此放过他，说要是他不同意的话就会将视频发给他身边的每一个，到时候所有的人都会对他指指点点。安全检查员妥协了，在新闻发布会上宣布了泄漏事件是因为天然气管道泄漏造成的。玛利亚四处找寻克劳迪托，米格尔让人将她接来，告诉她丈夫是自己的一个合伙人因为私仇而杀了他，玛利亚听后伤心不已。由于缺乏乙醚致使卡可因产量减少，齐皮不得不将主意打到了其他人身上。齐皮希望皇后街区的人能将乙醚让出来遭到了拒绝，一言不合齐皮就血洗了人家的地盘。晚上，潘那的妻子看着电视报道的云博地区惨案，对毒贩充满了反感，潘那看到新闻后坐立不安，总觉得自己应该对此负责。

在美国出台了银行保密法令后，对于超过一万美金以上的现金交易银行必须上报，因此洗钱行动应运而生。贩毒集团为了将贩毒的钱变得干净，采用了一系列的做法，但是所有的金钱交易不论如何掩盖都会留下痕迹，而打击卡利集团的最好办法就是找到金钱留下的痕迹。缉毒局的克里斯和菲斯通奉命来到卡里，卡利的卡尔德隆队长迎接了他们。菲斯通对于他们来意并没有全部告诉卡尔德隆，克尔德隆对此并不意外，只是提醒他们要想在卡利办成任何事情都要通过警察，就算那个警察不是自己。菲斯通只好说他们手上有些线索，现在来卡利就是想看看能不能把所有的线索连起来，除非卡尔德隆告诉他们吉尔伯托和米格尔藏在哪里。克尔隆德对此并不在意，说或许找遍整个卡利也找不到他们的踪迹。美国通过了一份克林顿名单，专门用来惩罚和贩毒集团有交集的公司。有了这份名单后，潘那的工作如鱼得水，很快就查到了卡利集团洗钱的头号人物尤拉多。潘那将尤拉多的现金记录拿给卡罗琳娜，卡罗琳娜居然对此相当熟悉。玛利亚得到了米格尔赠送的公寓，克蒙迪托的母亲以玛利亚的儿子为要挟，让她接受后变现，她要用毒贩的钱为自己的儿子复仇。豪尔赫的妻子带着孩子们出门，离开前反复和他确认今晚和投资人见面的约会。卡利集团的毒枭们聚在一起开会，豪尔赫格外的忙碌，安排好人手在各个地点蹲点以防警察突然出现。卡利集团为了获得安稳的生活答应了提前付款的要求，大家都想着如何在最后的六个月赚回来。卡利集团的总会计师帕罗马里说自己会回去准备这笔钱。豪尔赫把没过来的律师接到吉尔伯托开会的地方，帕罗马里出来将他迎接进去。为了最后六个月毒品的运输渠道，巴丘找到了华雷斯贩毒集团的阿马多。阿马多拥有天空之王的称号，对于巴丘的要求很爽快的答应了，但是要求巴丘和他一起去华雷斯市。克里斯和菲斯通在卡利还是一无所获，潘那让他们继续留意，说自己正在盯着尤拉多。克里斯和菲斯通很快发现了有几层大楼是吉尔伯托的产业，叫来卡尔德隆准备上去查看。卡尔德隆说自己会派人看住这里，让他们会波哥大申请搜查令，不想搜查令早就被克里斯和菲斯通握在手中，卡尔德隆只好调派人手支援。豪尔赫听到手下窃听到的电话内容，得知警察要搜查大楼，赶紧联系帕罗马里让他转移，但是帕罗马里根本就不听他的劝告。当豪尔赫刚到大楼是，克里斯和菲斯通已经带着人准备上去了。豪尔赫赶在他们到达之前来到办公室，抢先将所有的账目和机密文件藏了起来，自己抱着来不及藏起来的美金站在门后。克里斯和菲斯通一上来就查抄了所有的文件资料，菲斯通发现了帕罗马里的办公室，进去之后却一无所获。回去之后，克里斯和菲斯通正将查抄的文件整理分类，卡尔德隆却说他们不能将文件带走。一直监视着尤拉多的潘那发现他要去巴拿马，正准备跟着去时却被美国参议院的官员留下，说是要看看哥伦比亚的真实情况是什么。潘那无奈只好跟着大家来到军方的驻地，却敏锐的发现了敌方尸体上的弹孔和军队用的不一致。特工斯帝奇觉得卡利集团的招安对于哥伦比亚局势大有好转，希望能说服参议院将更多的资金投向军队，潘那对此并不赞成。玛利亚住进了公寓，问米格尔什么时候来，米格尔说这是她的家，她想要他来他就来。玛利亚问每个月是否有津贴，希望他能对自己争夺回儿子提供帮助。米格尔同意了，玛利亚接受了自己成为他的情妇。回去的时候，克里斯发现了帕罗马里说的是智利的语言，心中隐隐觉得事情不像他们看到的那么简单。两人守在帕罗马里的楼下，一路跟着送私密文件的帕罗马里，意外的来到了吉尔伯托的住处。当克里斯和菲斯通将着意外的收获告诉潘那后，潘那敲开了哥伦比亚军方负责人的门，问他是否想抓住吉尔伯托。

潘那带着菲斯通来到卡里，说是有毒贩藏身在这里，要秘密的进行搜捕。潘那当着卡尔德隆的面没收了警察的全部通信工具，就连克尔德隆的对讲机也被统一保管了起来，潘那还特意安排他和自己一起行动。对于此次的行动目标，潘那守口如瓶，只是说长期苦练，只待今天。车队浩浩荡荡的来到一所房子外，在潘那的指挥下所有的警察将屋里屋外搜了好几遍但是都没有任何的发现，潘那说明明情报就说巴丘现在在这里。趁着没人注意的时候，潘那吩咐菲斯通行动正式开始。搜索无果潘那只好让人撤离，回去的途中突然对卡尔德隆说要去拜访一个老朋友。缉毒局的人连同马丁内斯上校的人藏身在一辆运送鸡肉的车辆中，来到了吉尔伯格的住所钱，司机假装货车故障将安保人员吸引出来，车上的警察瞬间控制了安保人员，强行闯进了房子里。吉尔伯格是一个计划性特别强的人，他用自己的计划让三个妻子和平相处，打下了卡利集团这样的贩毒江山。这时有一个穿着吉尔伯格衣服的人仓皇出逃被抓了回来，三个妻子看到警察的架势神情也焉了。潘那带着卡尔德隆来到吉尔伯格的住所前，马丁内斯上校告诫卡尔德隆要改邪归正，不要破坏了他们的这次计划。卡尔德隆听到嗤之以鼻，说这里是他的地盘不是波哥大。他们将卡尔德隆的车钥匙拔下，将他单独留在了外面。潘那断定吉尔伯格没有离开这里，终于在隐蔽的楼梯下找到了蜷缩着的他。等在外面的卡尔德隆隐隐感到了事情不妙，趁着没人注意，他偷偷的将汽车打燃火，快速的溜出去，命令所有的警察要将潘那他们截留在卡利。潘那和马丁内斯得知卡尔德隆逃跑后，明白他一定会对他们的行动加以阻拦，于是快马加鞭的想要将吉尔伯格带出去。果不其然潘那的车在出去不久就遇到了前后夹击，被卡尔德隆的车逼的停了下来。当菲斯通从驾驶室出来打开货箱的门后，里面却什么都没有。卡尔德隆这才意识到他们被骗了，潘那的目标是要带着吉尔伯格去机场。当潘那好不容易感到机场时，面对的是哥伦比亚警察的荷枪实弹，潘那懊恼不已。马丁内斯单独下去给警察做思想工作，终于警察放下了手中的枪，吉尔伯格被顺利的送上了飞机。对于吉尔伯格的被捕，所有的人都颇感意外，就连吉尔伯格本人也不想不明白自己怎么会被抓到。吉尔伯格被捕的消息传到毒枭米格尔的耳朵，米格尔正在玛丽亚的公寓。豪尔赫被米格尔派去和人一起将玛丽亚的儿子从他的 祖母那里抢回来。豪尔赫带着玛丽亚的儿子回来时，所有的毒枭们已经聚在一起商量对策，吉尔伯格的儿子尼古拉斯甚至想去波哥大为父亲辩护，遭到了米格尔的反对。关于吉尔伯格的被捕，米格尔一直认为是科尔多瓦的错误，因为他作为吉尔伯格的安全主管没有起到作用，豪尔赫主动说是因为自己的失职，但是米格尔丝毫没有追究他的错误。尼古拉斯在监狱见到父亲，吉尔伯格对于他的出现并不放心，让他不要牵涉进来。尼古拉斯说自己发现了逮捕令的时效过期，看来事情还是有转机的。华雷斯的阿马多一直劝说巴丘继续和他合作，巴丘负责制造，他负责运输，说的巴丘有些心动。米格尔将吉尔伯格被捕的消息告诉巴丘，让他聪明行事，短时间内不要回来了。关于吉尔伯格的被捕美国和哥伦比亚两方持不同态度，哥伦比亚方面担心会破坏他们正在谈判的和平协议，要求马上释放他。知道哥伦比亚总统埃内斯托桑佩尔前来，说吉尔伯格的被捕已成定局，他和哥伦比亚的任何人民一样 ，有经受法律制裁的义务。潘那原本还忐忑的心情瞬间踏实了，可是在收拾文件的时候却发现了一张纸条，说要是谈判失败的话，所有的责任都应该他来承受。晚上，马丁内斯前来告诉潘那，说他们从卡里带回来的文件中有一份给警察的贿赂名单，其中就有自己，因此自己上交了警徽和枪，从此之后潘那就是一个人在战斗了。潘那沉默了许久，最终在吉尔伯格的照片上画上了大大的红叉。

吉尔伯格的被捕引起了卡利集团的高度重视，他们的安保工作前所未有的强化了。哥伦比亚政府因为担心抓捕吉尔伯格会破坏和卡利集团正在谈判的约定，将所有的责任都推向潘那，潘那压力倍增。吉尔伯格遭监狱买通了狱警，得到机会打电话给米格尔，让他约见北谷的埃维奥，一定要稳定好军心，在此期间，卡利集团的生意照常进行。米格尔不断的说是有人背叛了卡利集团，吉尔伯格说现在形势发生了变化，让他一定要加强自己的安保，现在她就是美国人的下一个目标。好在哥伦比亚的新总统埃内斯托桑佩尔对毒贩也深恶痛绝。菲斯通和克里斯在卡利被人控制了行动。潘那去见国防部长费尔南多，费尔南多说如果事实能够证明潘那是和自己站在同一战线的，他将会尽力为潘那提供方便。潘那趁机让他解除对克里斯和菲斯通的软禁。临走时，费尔南多提醒潘那要是想要将吉尔伯格绳之以法，就要找到可以指控他罪行的证人，潘那说自己正在和卡利集团的一个高级管理层接触。米格尔召集了豪尔赫和卡洛，要他们找出到底是谁出卖了自己，豪尔赫知道米格尔是不会善罢甘休的，安保系统是他们设计的，米格尔迟早会怀疑到他们头上，但卡洛不以为然。尼古拉斯带着律师来到监狱中见吉尔伯格，尽管律师一再保证招安计划会按照计划进行下去，得知律师还没有见到政府谈判官梅迪纳时，吉尔伯格还是大怒。尼古拉斯劝父亲要控制情绪，吉尔伯格明确的表示不希望他插手到这件事情中来。米格尔按照吉尔伯格的吩咐约见了埃维奥，玛利亚和儿子不小心出现在大家的面前，埃维奥敏锐的捕捉到了米格尔眼神中的恐惧。克里斯和菲斯通获得了自由，搬进一处隐蔽的屋里继续监视着卡利集团的一举一动。潘安在酒吧成功搭讪上尤多拉的妻子克里斯蒂娜，向她表明自己缉毒局的身份，希望她能够配合自己的工作，但克里斯蒂娜毫不犹豫的拒绝了。豪尔赫和卡洛在机场发现菲斯通和克里斯当初并没有像卡尔德隆说的那样离开卡利，卡洛决定将所有的责任都归咎到卡尔德隆的身上，于是找到卡尔德隆一番恐吓。米格尔听到这个消息并没有就此为止，而是要继续到底谁是卡利集团的叛徒，这让豪尔赫压力大增。潘安再次找到克里斯蒂娜，说自己只是想帮助她而已，尤多拉要是真的在乎她就应该做正确的事情。克里斯蒂娜说自己也知道这是一个错误的开始，但是也没答应潘那的要求。潘那只好留下自己的联系方式让她在想想。晚上，克里斯蒂娜打电话给尤多拉哭诉，潘那监听了两人的通话，从中找到了一条库里拉索的线索。尼古拉斯单独去拜访了梅迪纳，梅迪纳暗示他们需要重新商议招安的条件。当尼古拉斯把梅迪纳的意思告诉吉尔伯格时，吉尔伯格明显的感到了恐慌。巴丘在得知吉尔伯格的消息后一直不敢轻举妄动，加上阿马多在一旁不断的劝说他加入华雷斯集团，巴丘开始有些动摇了。豪尔赫去接女儿放学回家，一路上总是觉得有人在跟踪他。路上，豪尔赫接到电话说要开会，匆忙赶到了米格尔的住所。一进去豪尔赫就觉得气氛不对，果然一进去就看到了卡洛的妻子被人胁迫。戴维当着豪尔赫的面命人杀死了卡尔德隆，又带着他来到关押卡洛的地方。戴维告诉豪尔赫他们在卡洛准备逃跑的时候抓住了他，卡洛央求豪尔赫保护自己的妻女。当豪尔赫赶到的手，引入眼帘的是卡洛的妻女被杀后的满地狼藉。米格尔任命豪尔赫为新的保安队长，豪尔赫抗拒不了只好接受。回到家后，豪尔赫将自己锁进了洗手间。克里斯蒂娜打电话给潘那，问他是否可以保证自己和丈夫回到国内，说自己可以慢慢的劝说尤多拉和缉毒局合作，潘那自然答应了。豪尔赫发现了克里斯和菲斯通在跟踪监视自己，于是打电话给二人，说是可以相互帮助。

卡利集团是一个近乎完美的有机体，一直以来他们按照自己的计划将毒品生意运行的天衣无缝。但是所有的计划都有疏忽的时候，卡利集团位于纽约的毒品实验室因操作不当发生爆炸，这让缉毒局有机可乘。豪尔赫和菲斯通与克里斯约好在一处僻静的地方见面，豪尔赫将自己是卡利集团安全主管的身份告诉他们，说自己可以为缉毒局指控吉尔伯格出庭作证，条件就是必须让自己的家人到美国并且取得豁免权。菲斯通和克里斯则要求他能帮助他们抓到米格尔，豪尔赫说卡利集团的安全系统有自己设计，但是米格尔的安保由他的儿子戴维负责，就算是自己也不知道他在哪里。就算知道米格尔在哪里，缉毒局也没有可以信赖的人来抓捕他们，警察和军队都接受了卡利集团的贿赂。菲斯通和克里斯坚持要豪尔赫帮他们抓住米格尔，否则就没有多大的意义，豪尔赫答应自己好好考虑考虑。菲斯通问豪尔赫为什么要选择和缉毒局合作，豪尔赫说自己不是杀人犯，只是想把家人送走。克里斯觉得他们找到了重大突破口，但是菲斯通觉得没有这么简单。豪尔赫回去之后按照惯例安排安保工作，戴维对他的工作挑三拣四，要求所有的安保人员必须全部配枪。手下的人问豪尔赫为什么不把缉毒局特工在卡利的事情告诉戴维，豪尔赫称现在最不能发生的就是他们的人杀死缉毒局特工了，所以缉毒局特工的事情他们自己监视就好了。纽约的爆炸案让齐皮很不安，很快新闻就爆出了有人发现这里面有一个庞大的组织，即将对此案展开进一步的调查，齐皮本想带妻子离开，现在决定留下了了解此事。尼古拉斯找到米格尔将新谈判定下的协议内容告诉他，并建议除掉会计帕罗马里。米格尔觉得除掉帕罗马里的风险过大，觉得暂时由豪尔赫将他转移。尼古拉斯走后，戴维对他的不满爆发了出来，极力说服米格尔代替吉尔伯格当卡利集团的老大，出席当地的舞会。此时，北谷集团的埃维奥找到马里多，说服他和北谷集团合作。当戴维将米格尔要参加聚会的消息告诉豪尔赫之后，豪尔赫找到机会通知了克里斯和菲斯通。两人拿到了豪尔赫的资料，对于豪尔赫的消息半信半疑。潘那在索马里岛警方的协助之下，将尤拉多顺利的抓捕。潘那极力的说服尤拉多出庭指控吉尔伯格，尤拉多答应只要见到妻子就和答应他的要求。克里斯蒂娜回家看到警察站在门口，急忙返回美容院。克里斯蒂娜在酒店没有找到尤多拉的消息，只好向潘那求助，潘那让她赶紧去美国大使馆。再去大使馆的途中，克里斯蒂娜被卡利集团的人带走了。齐皮将报道爆炸案的主编约了出来，企图说服他放弃对爆炸案的进一步追踪，但主编拒绝了，齐皮残忍的将他枪杀。米格尔来到舞会，戴维很享受人们的吹捧。豪尔赫再厕所见到菲斯通，得知他们并没有带人过来后让他们赶紧离开。舞会中响起了枪声，而且目标直指米格尔，北谷的毒贩们想要趁机将 卡利集团一锅端。豪尔赫和戴维在枪林弹雨中护送米格尔离开，米格尔对豪尔赫的中心相当满意，将自己的安保全权交给了他。此时，巴丘也受到了猛烈的攻击，所幸一番恶战之后性命得意保全。豪尔赫到菲斯通的住所质问他们为什么不带人过去，菲斯通说因为他们不缺他的真实意图是什么。豪尔赫将卡利集团杀死钱前全主管的事情告诉他们，说自己只是想把家人弄出去。豪尔赫给两人留下了一部改装的电话，说任何人都无法窃听到通话内容。晚上豪尔赫回到家，妻子担心不已，豪尔赫告诉她自己和缉毒局的交易，妻子坚决不同意。尤多拉没有看到妻子拒绝和潘那合作，尤多拉的律师告诉潘那克里斯蒂娜去见了卡利集团的人，想让尤多拉指证卡利集团的希望就此破灭了。米格尔把北谷的这次突袭视为开展的信号，吉尔伯格得知发生的事情后打电话让米格尔冷静，不要挑起战争。米格尔根本就听不进去。

吉尔伯格领导的卡利集团一直占据着行业老大的位置，他们利用自己的关系网络为其他的毒贩集团提供庇护，从中获取大部分的利润，一直以来，这种模式都完美无瑕，但是吉尔伯格在进行招安谈判的时候却没有预想到其他的人一直对于行业老大的位置虎视眈眈，比如说北谷贩毒集团。北谷集团的挑衅引起了卡利集团的高度不满，巴丘带着人冲到北谷的教堂，当众向埃维奥喊话。但是北谷集团也毫不示弱，因为他们把控了最大的港口。米格尔和巴丘与齐皮商量，无论如何一定要夺回港口，向北谷彻底的复仇。豪尔赫找到菲斯通和克里斯，问他们已经知道了米格尔的行踪为什么还不逮捕他，菲斯通告诉他这种行动必须经过审批才行。三人商量着逮捕米格尔的计划，豪尔赫答应帮助他们进入大楼。潘那去找国防部长费尔南多，但是没有向他透露任何的行动细节。费尔南多答应了他们为他们提供了赛拉诺将军。赛拉诺将军有着极强的信仰和原则，虽然多次遭到暗杀但是从未向毒贩妥协过。潘那将此次行动毫无保留的告诉了赛拉诺将军，两人针对这次行动计划进行了详细的讨论和研究。赛拉诺说现在的问题是这次突击行动是需要自己上报卡利政府审批的，到时候米格尔也会收到风声的。潘那说服撕拉诺将军不要出现在这次行动中，生怕行动失败会危机他的名声，赛拉诺思考之后答应了。豪尔赫回到家发现妻子正在整理行李，要带着孩子到自己的父亲那里，但是妻子不愿意带着儿女背井离乡。晚上豪尔赫按照约定来到米格尔的住处，米格尔对他赞赏有加，非要他留下来吃饭。米格尔要求他监听吉尔伯格的电话，豪尔赫感到很意外。豪尔赫趁着米格尔和厨师费多不注意，悄悄的将对讲机关掉。当外面的安保人员发现警察冲进大厦时，对讲机静悄悄的一点声音都没有。米格尔和厨师很快察觉到了潘那乘坐的飞机的声响，慌忙问豪尔赫到底是怎么回事。豪尔赫让米格尔想办法离开这里，和费多留下来一起面对缉毒局。潘那让地方检察官当面填写好搜捕令，带着人控制了局面，警察在屋里展开了地毯式的搜索，但是一无所获。潘那想到可能是米格尔篡改了楼层结构，于是跑到楼下的家里丈量了尺寸。相比之下，缉毒局在浴室发现了异常，潘纳当场决定砸开整个墙面。米格尔确实躲在里面，听着外面电钻钻进墙体的声音，看着电钻在自己面前旋转，甚至将自己的胳膊刺伤的，米格尔都只能忍着不敢出声。米格尔陷入危险的消息传到戴维的耳朵中，戴维带着人气急败坏的找到了卡利的司法局长，让他去救自己的父亲。正当缉毒局要砸掉整面墙体是，司法局长及时出现阻止了他们。司法局长没收了他们的护照，扬言要对他们进行申诉。潘那只好宣布结束了行动，米格尔也得以逃过一劫。搜捕米格尔的行动引起了媒体的关注，吉尔伯格得知后带电话给米格尔，让他接受和政府新达成的协议，千万不要和缉毒局再起冲突。但是米格尔彻底的听不进去。豪尔赫得知菲斯通和克里斯被召回波哥大的消息慌乱不已，他还指望着他们将他的妻女送到美国去。豪尔赫在家里发现有人监视他的家，只得动手将自己的枪支组装好。

卡里斯蒂娜被卡利集团的人带到了深山老林中，交给了另外的人看管。米格尔对于此次差点被抓住火冒三丈，认为一定是内部有人将消息泄露了出去。大家觉得恩里克的嫌疑很大，因为他当时应该在外面守着的。豪尔赫开车来到丈母娘家外，看着妻子和女儿安好心中暂时松了口气。戴维打来电话，要求他将恩里克带带他们的面前，说米格尔想要和他谈谈。豪尔赫心中一惊，戴维说米格尔也要见他。费尔南多因为此次突击行动的失败而指责缉毒局，要求他们将包括告密者在内的信息通通移交给特别检察官，并且不再参加以后的行动。潘那只得将他们搜获的账本拿给费尔南多，说现在有两个人可以破译它，一个是卡利集团的会计帕罗马里，一个就是被抓获的尤拉多。现在必须双方共同合作才能破译出卡利集团的贩毒网络。费尔南多被迫答应了缉毒局继续参加后续行动。潘那找到麦德林集团的伯纳，伯纳将克里斯蒂娜被绑架到深山老林的消息告诉了潘那。伯纳主动提出帮潘那救出克里斯蒂娜，条件就是潘那要为他提供保护。菲斯通和克里斯对豪尔赫担心不已。豪尔赫找到恩里克，将戴维怀疑他的事情告诉了他，将他带到安全屋藏了起来，承诺他自己一定会替他解决好这次的事情，嘱咐他倩倩不能离开房间。豪尔赫找到米格尔替恩里克开脱，戴维将嫌疑转移到她的身上，豪尔赫祝好说可能是缉毒局用了新的无线装置监听到他们的通话。米格尔虽然赞同豪尔赫的看法，但是依然坚定的认为是有人出卖了他。吉尔伯格打电话给米格尔，继续说服他接受谈判，这次米格尔直接驳斥了他。无奈吉尔伯格只得叫来尼古拉斯，让他参与处理尤多拉的事情。豪尔赫和戴维一起去恩里克家没有发信恩里克的踪迹，戴维让他去黑牛森林找纳威甘蒂。出来后发现有人在跟踪他，他在窃听器里听到戴维说要杀死自己的妻子，豪尔赫心中大惊。豪尔赫再黑牛森林接到纳威甘蒂，两人一同去找帕罗马里，但是没有发现任何的踪迹纳威甘蒂要豪尔赫一定要找到帕罗马里，米格尔认为这是当务之急，豪尔赫答应了。豪尔赫接到电话说找到恩里克了，心中骤然一凛，一阵思索之后将BB机的信息删除。当豪尔赫再次见到恩里克时他已经被戴维折磨的奄奄一息了，在戴维的威胁之下，恩里克将豪尔赫和缉毒局联手的事情说了出来。为了自保豪尔赫只有说恩里克是在诬陷他，但戴维和米格尔都不愿意再相信他。这时恩里克身上的BB机，豪尔赫趁机说恩里克就是内奸，这就是他们通信的工具，可以追踪他们的行踪，米格尔和戴维听后，直接捂死了恩里克。潘那在伯纳的带领下，成功借用卡斯塔尼奥家族的武装力量将克里斯蒂娜救出来，但克里斯蒂娜对此并不领情，明确表示尤拉多不会因为潘那救出了她而和他们合作。此时，尤多拉已经在狱中被尼古拉斯收买的杀手夺去了性命。豪尔赫因为担心自己的妻女被戴维伤害，再次致电给菲斯通，要求再次合作。他会提供米格尔的地址，但是缉毒局必须保证他们要将他抓捕。

米格尔监听了吉尔伯格的电话，听到吉尔伯格说服齐皮和巴丘接受新的谈判协议，但是巴丘认为自己还没有做好被招安的准备。米格尔将偷袭他的北谷集团毒贩的尸体送到埃维奥的眼前，让他打电话给自己。潘安告诉美国大使费尔南多就是他们之中的叛徒，是他向卡利集团泄密的，美国大使不愿相信。潘那说他们的线人压下了自己的身家性命，只有抓到了米格尔才能保证他的安全，大使反问他哪件事情更重要。豪尔赫发来信息说米格尔有了新的藏匿之处，克里斯建议潘那放手一搏现将豪尔赫解救出来，潘那最后决定在今天之内采取行动抓捕米格尔。潘那找到赛拉诺将军，将米格尔的信息告诉他，希望他能够再次为缉毒局提供支持。赛拉诺将军说上次之后他的上级已经找过他谈话，即使现在抓住米格尔他也会很快出来的。潘那保证不会让米格尔可以从监狱出来，赛拉诺将军决定放手一搏。菲斯通将行动的消息通知豪尔赫，豪尔赫非常担心家人的安危。豪尔赫回到家将情况告诉妻子，让她不要担心自己。米格尔将齐皮和巴丘叫到一起，明确的告诉他们自己监听了吉尔伯格的电话，说吉尔伯格的招安计划根本行不通，想两人承诺的事情也只是他的计谋之一。米格尔将纽约的毒品实验室给了齐皮，将暗杀巴丘的北谷集团的毒贩藏身之处告诉了巴丘。三人很快就达成了共识，米格尔正式取代吉尔伯格成为卡利集团的头号教父。豪尔赫告诉米格尔缉毒局的特工回到了卡利，建议米格尔马上转移，米格尔同意了，开始收拾东西。戴维带着人找到了缉毒局在卡里的窝点，但是没有发现里面有和豪尔赫有关系的线索。不幸的是，戴维在离开的时候发现街角有监控，拿到录像一看之后发现豪尔赫出现在了这里，戴维断定豪尔赫就是他们要找的内奸。潘那故意将抓捕米格尔的消息泄露给费尔南多，随后就去找了卡罗琳娜。卡罗琳娜说她在潘安给他的账本上发现了费尔南多接受卡利集团贿赂的证据。米格尔接到费尔南多的电话将消息告诉了豪尔赫，更加坚定豪尔赫的情报是准确的。戴维打电话给米格尔想要告诉他豪尔赫就是内奸，但米格尔正在听电话录音没有注意到，豪尔赫发现也没有提醒他，而是起身出去了。菲斯通看到豪尔赫出来就通知潘那说消息已经传过去了，潘安更加肯定费尔南多就是内奸。玛利亚的儿子看到电话后拿给米格尔，米格尔知道后将豪尔赫叫了进去。菲斯通发现豪尔赫进去之后暗叫不好，马上向潘那汇报了情况，要求立即冲进去保证豪尔赫的安全，潘那答应了。果然，豪尔赫一进去之后就发现气氛不对，米格尔让人控制住豪尔赫，斥责他吃里扒外背信弃义。米格尔要亲自处死豪尔赫，用塑料袋死死的套住他的头，豪尔赫呼吸越来越困难。好在菲斯通及时的闯了进来，米格尔仓皇出逃，豪尔赫才得以安全。米格尔刚逃出去不久，就被赛拉诺将军拦住，至此米格尔被正式拘捕。克里斯赶在戴维之前到达豪尔赫家里，将他的妻女安排在楼上，自己独自留下对付戴维两人。在一番激烈的交战之后，成功的将她们带了出来。得知妻女平安后，豪尔赫知道他们的计划成功了。潘那得知米格尔被抓和豪尔赫安全的消息后大喜。卡洛琳娜来告诉他，卡利集团通过尤多拉进入费尔南多竞选团队的钱已经弄清楚了，全被用在了总统竞选上，这就不构成洗钱，只能算是政治献金。潘那将费尔南多和卡利集团勾结，甚至总统也卷了进来的事情报告给大使，大使将中情局的窃听电话那给潘那，说这件事情他们早就知道了。潘那明白，大使的意思是他们不会插手此事。米格尔在狱中见到了吉尔伯格，吉尔伯格说他被捕对于整个招安计划来说是有利，现在只需要巴丘和齐皮自首就可以了。深夜，潘那站在卡利集团的关系图钱沉思，中情局特工告诉他不论怎样他都是抓住两个毒枭的英雄。潘那问他是否早就知道录音的事情，特工告诉他事情重要的从来不是如何达成目标，而是目标达成之后怎么办。潘那沉默了，静静的看着示意图，然后转身离开。

巴丘带人血洗了北谷集团替弟弟报仇，然后找到赛拉诺将军主动自首。吉尔伯格兄弟被捕，巴丘和齐皮相继自首，哥伦比亚总统迅速向全世界宣布卡利集团宣告倒台。这场战争看似是正义的胜利，实际上胜利的是卡利集团的毒枭们。毒贩们在狱中受到了严密的保护确使他们性命无忧，四人在狱中相聚，吉尔伯格说以前的投资很快就有回报，一切问题都会迎刃而解，到时候他们会取得伟大的胜利，在推杯换盏之间，四人很快就重新凝聚在一起。豪尔赫即将启程去美国，潘那找到他希望能够提供会计帕罗马里的行踪，豪尔赫却担心贩毒集团会继续对他的家人不利。潘那告诉他要是没有帕罗马里的指控，卡利集团的毒枭们很快就会被放出来的。同时盯上帕罗马里的还有卡利集团的毒贩们，米格尔打电话让戴维一定要找到他。而此时的帕罗马里已如惊弓之鸟，他已经准备向政府自首，但律师建议他赶紧带家人逃走。豪尔赫告诉妻子自己还要配合缉毒局找到帕罗马里，妻子一听就崩溃了，明确的告诉他自己要带着女儿离开。米格尔让戴维照顾好玛利亚，玛利亚来找戴维想要把自己的儿子安排好时，戴维却让她离开米格尔，这让玛利亚觉得很屈辱。玛利亚找到北谷集团的埃维奥，向他寻求庇护。菲斯通和克里斯陪着豪尔赫来到卡里集团的电话中心，监听了帕罗马里妻子办公室的电话。潘那到帕罗马里妻子的公司打探她的行踪，很快妻子的情人就打电话通知了她，豪尔赫根据通话信息找出了帕罗马里的藏身位置。会计妻子的情人找到戴维讨价还价，说自己知道帕罗马里在哪儿，戴维不理会他的威胁，亲自将他一顿暴打，得到了帕罗马里的位置。潘那带着菲斯通和克里斯到达帕罗马里的家里，他的妻子依然不愿意离开。帕罗马里和潘那讨价还价，潘那忍不住把他现在危险的处境分析给他，许诺他们会被带到美国得到保护。纳威甘蒂奉戴维的命令来杀死帕罗马里，正好在车里发现放风的豪尔赫，他威胁豪尔赫不能将消息告诉给缉毒局，豪尔赫只能照办。潘安好不容易说服帕罗马里一家，临出来时向豪尔赫询问大厅外面是否安全，豪尔赫违心的答应了。就在纳威甘蒂准备下车杀死帕罗马里的时候，豪尔赫开枪将他杀死。随后，帕罗马里一家被送上了去美国的飞机，逃离了卡利集团的魔掌。戴维得知刺杀帕罗马里的行动失败后气急败坏，准备亲自在机场截杀他。戴维一出门就被北谷集团的人突袭，只能鲜血直流的躺在地上求救无门。帕罗马里在美国接受了审判，他供诉的关于卡里贩毒集团对哥伦比亚政府的影响引起了人们极大的关注，虽然哥伦比亚政府一再否认，哥伦比亚人民对政府产生了严重的怀疑。向桑佩尔总统表明卡利集团的交付们不能出狱，但是潘那已经起草了一份向桑佩尔总统和贩毒集团勾结的起诉书。大使认为潘那太过天真，但潘那坚持一试。潘那最终还是接受了卡罗琳娜的采访，将真相公布于众。一时之间，美国大使和潘那承受了极大的压力，大使将潘那遣送回过，潘那主动从缉毒局辞职了。随后，哥伦比亚政府和毒枭交易的录音被曝光，总统迫于形势压力直接宣布自己和卡利集团没有任何关系，卡利集团的教父们也不会获得任何的豁免。齐皮越狱准备东山再起却因对方要求的金额超出了自己的承受范围被杀，巴丘也在监狱中被北谷集团的人复仇，吉尔伯格兄弟被引渡到美国，在监狱中度过剩下的时光；豪尔赫消失在美国的某地，被美国政府严密的保护起来。潘那回到缉毒局，对于人们吹捧他的成就并没有很开心，他担心的是扳倒了一个贩毒集团后会成就新的贩毒集团。局长说不管怎样那些后起之秀要成气候都需要时间，他撤销了潘那的辞职，邀请他去负责墨西哥的缉毒工作。潘那回到家乡，父亲问他是否要接受去墨西哥的邀请，潘安觉得自己承认的已经够多了，他的使命已经结束了。（第三季本季终）